Em 19 de janeiro de 2012, o Departamento deJustiça dos Estados Unidos apreendeu e fechou o site Megaupload.com e iniciou processos criminais contra seus proprietários e outros. Em todo o mundo, o Federal Bureau of Investigation prendeu Kim Schmitz (Fundador), Finn Batato (CMO), Mathias Ortmann (CTO e co-fundador), com Bram van der Kolk preso pela Agência de Crimes Organizados e Financeiros da Nova Zelândia. Seu pedido de fiança foi negado no tribunal neozelandês por ter recebido a oposição das autoridades americanas no caso. Em 20 de janeiro, a alfândega de Hong Kong congelou mais de HK$300 milhões (US$39 milhões) em ativos pertencentes à empresa.
O caso chamou especialmente a atenção do público porque as prisões aconteceram no dia seguinte a um grande protesto contra a legislação proposta para expandir a autoridade legal dos Estados Unidos contra sites de pirataria estrangeiros. Pouco tempo depois, o site do Departamento de Justiça e vários outros sites de outras organizações foram retirados do ar após ataques de negação de serviço do grupo ativista Anônimo.
Um porta-voz do grupo descreveu os ataques como "o maior ataque da Internet na história [do grupo]" em uma entrevista, acrescentando que foi "um terrível caso de acaso que os agentes federais foram atrás do Megaupload apenas horas depois que os milhares de sites que protestavam em um apagão anti-SOPA voltaram a ficar on-line". Os internautas estavam prontos para defender uma Internet aberta... os federais 'não poderiam ter escolhido um momento pior para derrubar a Megaupload'". Ele observou que desde o início até o ponto em que os servidores web do governo estavam offline era de apenas 70 minutos.
Além do Ministério da Justiça, o ataque de Negação de Serviço incluiu Universal Music Group, Recording Industry Association of America (RIAA), Motion Picture Association of America (MPAA), Broadcast Music, Inc. (BMI), e o website do Federal Bureau of Investigation. "Mesmo sem a aprovação da SOPA, o governo federal sempre teve um tremendo poder para fazer algumas das coisas que eles querem fazer. Portanto, se isto é o que pode ocorrer sem que a SOPA seja aprovada, imagine o que pode ocorrer após a aprovação da SOPA", disse Brown à RT. Anônimo também atacou o site da organização antipirataria da França.
Em 19 de janeiro de 2012, o Anonymous divulgou uma declaração no Pastebin.com aceitando a responsabilidade pelos ataques em massa a websites, incluindo os da RIAA, MPAA, BMI, FBI e outros.