1884–1989
O clube foi fundado em 1884, após uma ruptura com uma equipe local chamada Heather Rangers. Em 1890, os Guerreiros se mudaram para Ochilview Park, seguindo feitiços no Tryst Park e no Goschen Park. No início do século 20 o clube teve um breve período de sucesso, ganhando a Copa Escocesa de Qualificação duas vezes em 1901 e 1902. Em 1902-03, o clube chegou à semifinal da Copa da Escócia, perdendo por 1-4 em casa para o Rangers. Na temporada 1921-22, o Stenhousemuir competiu pela primeira vez na Liga Escocesa de Futebol Sênior.
Em 1925-26, o goleiro Stenhousemuir Joe Shortt recebeu um suborno de 50 libras esterlinas para lançar uma partida contra Broxburn, mas ele rejeitou a oferta e os Warriors venceram a partida por 6-2. Um bookmaker de Bainsford, uma pequena vila nos arredores de Falkirk, foi posteriormente preso por tentativa de conserto de partida. []
Em 1928, a bancada de madeira do Ochilview Park ardeu em um incêndio, o que levou à construção de uma nova bancada em seu lugar, embora tenha sido necessário acrescentar escadas mais tarde devido a erros de planejamento. Durante a temporada 1936-37, o clube bateu um recorde - uma vitória por 9-2 contra o Dundee United. Mais de uma década depois, em 1949-50, um empate nas quartas-de-final da Copa da Escócia contra o East Fife atraiu um público recorde de 12.500 pessoas - o mais alto de todos os tempos no Ochilview Park. []. Em novembro de 1951, o primeiro jogo iluminado por inundação entre duas equipes seniores escocesas ocorreu no Ochilview Park, entre Stenhousemuir e Hibernian. []
No verão de 1964, o Rangers FC revelou à The Scottish Football League um plano para retirar os Warriors da liga, juntamente com outros quatro clubes, com base no fato de que eles eram os clubes mais pobres apoiados durante as três temporadas anteriores. Quatro anos depois, Stenhousemuir, juntamente com o Albion Rovers, Berwick Rangers, Brechin City e Stranraer, com o apoio de vários clubes, incluindo Celtic F.C., Hamilton Academical F.C. e Airdrieonians F.C., derrotou com sucesso este plano.
Em 1972-73, os Warriors derrotaram o Rangers por 2-1 no Estádio Ibrox, na Copa da Liga Escocesa. Notadamente, o Rangers era o campeão da Copa dos Vencedores da Copa da UEFA na época. []
1990-presente
Em 1992-93, a equipe permitiu que seus rivais Stirling Albion compartilhassem seu estádio Ochilview Park. Na temporada 1993-94, os Warriors saíram da liga inferior pela primeira vez, devido à formação da terceira divisão escocesa. A metade dos anos 90 foi um dos períodos de maior sucesso do clube em sua história; em 1994-95 eles derrotaram St. Johnstone por 4x0 e Aberdeen por 2x0, ambos com adversários da liga superior, na rota para as quartas-de-final da Copa da Escócia. Na temporada 1995-96, Stenhousemuir venceu a Scottish Challenge Cup, derrotando o Dundee United por 5-4 nos pênaltis, após 90 minutos sem gols e tempo extra. No processo, alcançando sua primeira semifinal nacional desde 1902.
Stenhousemuir foi relegado da segunda divisão escocesa para a terceira divisão escocesa pela primeira vez na história do clube. [] Entretanto, na temporada seguinte, a promoção vencedora de volta à Segunda Divisão, também a primeira na história do clube.
Em 2006-07, o clube anunciou um plano para colocar grama 'falsa' no Ochilview Park. Tornou-se o primeiro no Reino Unido a passar no credenciamento da categoria 2 Estrelas da FIFA.
Stenhousemuir foi promovido para a segunda divisão escocesa após derrotar o Cowdenbeath por 5-4 nos pênaltis após empatar em 0-0 no placar agregado na final da repescagem no final da temporada 2008-09. A temporada 2010-11 viu o clube evitar por pouco o rebaixamento depois de passar a maior parte da temporada na zona de rebaixamento. No último dia da temporada, o clube derrotou Peterhead por 3-0 para passar acima do Alloa Athletic e, portanto, evitou o play-offs de rebaixamento.
Para a temporada 2011/2012, o Kit Home é patrocinado pela Figura 11 Communications Ltd, o Kit Away é patrocinado pela Apex Hotels, e a parte traseira do patrocinador do kit é a Wright & MacLennan.