Johnathan James Aitken (nascido em 24 de maio de 1978) é um defensor canadense aposentado do hóquei no gelo. Aitken foi esboçado no 8º esboço geral da NHL em 1996 pelos Bruins de Boston e jogou três jogos por eles. Para a temporada 2000-01, juntou-se ao HC Sparta Praha na República Tcheca. Ele retornou à América do Norte após apenas um ano, e voltou à NHL durante a temporada 2003-04 com o Chicago Blackhawks, jogando 41 jogos. Depois disso, ele se transferiu para a Liga Austríaca de Hóquei do Klagenfurt AC na temporada 2006-07, antes de se aposentar do hóquei.