Gordon Wu, que foi o fundador da Hopewell Holdings, pensou em uma ponte e um túnel que ligaria a China, Hong Kong e Macau. Isto foi em 1983. Ele disse que teve a idéia da ponte Túnel da Baía de Chesapeake. Depois disso, em 1988, ele mostrou as idéias ao governo em Guangzhou e Pequim. Em sua idéia, a ponte começaria mais ao norte do que o projeto que foi realmente construído. Ele queria que a ponte começasse em Black Point, perto de Tuen Mun, Hong Kong. Atravessaria então o Rio das Pérolas passando pela Ilha Neilingding e a Ilha Qi'ao. Em sua idéia, a ponte terminaria em Tangjia e haveria uma estrada de Zhuhai para Macau. As conversações entre o governo e Wu pararam após o massacre da Praça Tiananmen em 1989. Isto porque isso preocupava os investidores estrangeiros.
O governo de Zhuhai gostou desta idéia e a promoveu. O nome deles para a ponte era Ponte Lingdingyang. Nos anos 90, Zhuhai construiu uma ponte que ligava a China continental à ilha de Qi'ao. Esta ponte deveria ser a primeira parte do sistema, embora os governos chinês e de Hong Kong ainda não tivessem aprovado o plano. O governo chinês apoiou a ponte em 1997. O governo de Hong Kong não disse se a apoiava ou não. Isto porque eles estavam estudando o tráfego entre Hong Kong e a China e estavam preocupados com o efeito que isto teria sobre o meio ambiente.
Para iniciar o projeto e garantir o bom andamento das coisas, foi criado em 2003 o Grupo de Coordenação de Trabalho Avançado da HZMB. Pessoas que trabalharam para os governos de Zhuhai, Macau e Hong Kong trabalharam no planejamento da ponte, como a patrulha de fronteira funcionaria e como a ponte seria paga.
Em 2009, os governos da China, Guangdong, Hong Kong e Macau concordaram em pagar por 22% da ponte. O restante do dinheiro, 78%, foi pago por um grande número de bancos, como o Banco da China.