A área era o lar tradicional da Yandruwandha, Aborígenes. O primeiro europeu a visitar a área foi Charles Sturt, em 1845. Ele foi seguido por A C Gregory em 1858 e depois por Burke e Wills. Um monumento a Sturt, Burke e Wills foi construído em Innamincka, em 1944.
Em 1882 foi criado um acampamento policial e seguiu-se um pequeno assentamento. A partir de 7 de abril de 1889, um ônibus do Royal Mail veio quinzenalmente de Farina, operado pelos comerciantes Davey e Pilkington. A cidade recebeu o primeiro nome de Hopetoun em homenagem ao governador de Victoria, o Conde de Hopetoun, mas nunca foi popular entre os habitantes locais. A cidade nunca foi muito grande, mas tinha um hotel, uma loja e uma delegacia de polícia. Até 1901, a delegacia de polícia era também o posto da alfândega para cobrar impostos sobre o gado trazido por terra de Queensland para o Sul da Austrália. Em 1928, a Missão Interior Australiana construiu aqui um hospital, o Lar Elizabeth Symon Nursing Home. A seca severa e o fraco acesso ao assentamento resultaram no fechamento do hotel e do hospital. Em 1951, o posto policial fechou e a cidade foi abandonada.
O aumento do turismo e a descoberta de gás e petróleo no final dos anos 60 levou à formação da Cooper Creek Hotel Motel Pty Ltd. A empresa abriu um hotel, uma loja e alojamento na cidade abandonada. Em 1994, o Lar Elizabeth Symon Nursing Home foi restaurado por Dick Smith e pela Australian Geographic e utilizado como centro de visitantes para Parques e Vida Selvagem do Sul da Austrália.
A cidade comum, nas margens do Cooper, é popular entre os campistas, assim como os banheiros e chuveiros públicos da cidade.