O Bas-Rhin é um dos 83 departamentos originais criados durante a Revolução Francesa em 4 de março de 1790. Foi dividido em quatro distritos: Haguenau, Benfeld, Estrasburgo e Wissembourg, com Estrasburgo como capital. Logo, foi criado o distrito de Sarre-Union e o nome do distrito de Benfeld foi alterado para Sélestat (em suas origens, Schlestadt).
Em 1800, com a criação dos arrondissements na França, os cinco distritos foram transformados em quatro arrondissements: Estrasburgo, Barr, Saverne e Wissembourg. A subprefeitura de Barr foi transferida para Schlestadt (Sélestat) em 1806.
O departamento do Bas-Rhin foi eliminado em 1871, quando o território passou a fazer parte da Alemanha.
Em 1919, o Bas-Rhin é novamente um departamento quando o território se tornou parte da França com os arrondissements Strasbourg-Ville, Strasbourg-Campagne, Erstein, Haguenau, Molsheim, Saverne, Sélestat e Wissembourg.
Os arrondissements Sélestat e Erstein foram combinados em 1974 para formar o arrondissement de Sélestat-Erstein.
Em 2015, os arrondissements Strasbourg-Campagne e Wissembourg foram eliminados e seus territórios passaram para os restantes arrondissements, e apenas 5 foram mantidos: Haguenau-Wissembourg, Molsheim, Saverne, Sélestat-Erstein e Estrasburgo.