A engenharia de proteção contra tsunamis tem o objetivo de prevenir ou mitigar possíveis danos e salvar vidas. O melhor método de proteção parece ser o uso de muros de mar em frente aos portos e cidades. Outro método eficaz de um tsunami é o plantio adequado de árvores. Alguns vilarejos na Índia, por exemplo, tiveram baixas mínimas no tsunami de 2004 por terem plantado árvores ao longo da linha costeira.

A engenharia de proteção contra tsunami também deve prever e prevenir situações como a que aconteceu na Usina Nuclear Fukushima Daiichi quando a energia principal caiu, os geradores de reserva falharam e a água de resfriamento não pôde chegar ao combustível nuclear. O superaquecimento que se seguiu levou a explosões, incêndios e liberação perigosa de radiação.