Big Boss é um personagem recorrente na série de videogames Metal Gear, que serve como um herói ou vilão. Foi ele quem deu os genes para fazer três clones de si mesmo, Solid Snake, Liquid Snake e Solidus Snake. De certa forma, isto faz dele seu pai. Ele começa como soldado da equipe das forças especiais da CIA, a Unidade FOX. Mais tarde, ele mesmo cria e lidera uma equipe das forças especiais, a FOXHOUND.
Em Metal Gear Solid 3, o Big Boss resgata sem sucesso o cientista Sokolov, porque seu mentor, o chefe, muda de lado dos Estados Unidos para a União Soviética. No início, ele não entendeu o porquê. Mais tarde, explica-se que o governo ordenou que ela mudasse de lado, porque ela era o único soldado que Volgin respeitaria e confiaria o suficiente para manter o legado dos Filósofos durante a Segunda Guerra Mundial. Mais tarde, o chefe se reúne com sua antiga equipe de colegas soldados, a Unidade Cobra. Ela sabia que o Grande Chefe, que era chamado de Cobra Nua no jogo, teria que matá-la como parte de sua missão, mas ela queria passar seu objetivo para que ele completasse. Depois de descobrir a verdadeira razão da morte do chefe, ele perde seu patriotismo e quer unir o mundo sob um único governo. Isto é para que os governos do mundo não ameacem destruir-se uns aos outros com armas nucleares. O governo lhe dá um novo nome de código, Big Boss. Ele não gosta do nome de código, porque o lembra que ele foi dado a ele por matar o Boss. Ela era uma das únicas de quem ele realmente se importava.
Em Metal Gear 1 & 2, o Big Boss tenta usar Metal Gear para destruir os governos do mundo, mas o agente FOXHOUND Solid Snake (que também é um dos clones do Big Boss) o destrói e o detém.