Desde o censo de 2000, havia 49.832 pessoas, 21.294 domicílios e 15.672 famílias vivendo no município. A densidade populacional era de 103 pessoas por milha quadrada (40/km²). Havia 24.452 unidades habitacionais com uma densidade média de 50 por milha quadrada (19/km²). A composição racial do condado era 87,27% de brancos, 8,83% de negros ou afro-americanos, 0,27% de indígenas americanos, 1,17% de asiáticos, 0,02% de ilhas do Pacífico, 0,96% de outras raças, e 1,47% de duas ou mais raças. 5,09% da população eram hispânicos ou latinos de qualquer raça. 90,1% falavam inglês, 5,0% espanhol e 1,2% alemão como sua primeira língua.
1,8% da população se identificaram como sendo de ascendência indiana ocidental não-hispânica.
Em 2000, havia 21.294 lares, dos quais 21,10% tinham filhos menores de 18 anos, 62,80% eram casais que viviam juntos, 8,10% tinham uma mulher que não tinha marido presente, e 26,40% não eram parentes. 21,60% de todos os lares eram compostos por pessoas vivendo sozinhas e 12,00% tinham alguém vivendo sozinho com 65 anos de idade ou mais. O tamanho médio da família era de 2,32 e o tamanho médio da família era de 2,67.
No município, a população estava distribuída com 17,90% menos de 18 anos, 4,80% de 18 a 24, 20,30% de 25 a 44, 28,30% de 45 a 64, e 28,60% com 65 anos ou mais. A idade média era de 50 anos. Para cada 100 fêmeas, havia 92,10 machos. Para cada 100 fêmeas com 18 anos de idade ou mais, havia 89,90 machos.
A renda mediana para uma família no condado era de $40.214, e a renda mediana para uma família era de $45.625. Os homens tinham uma renda mediana de $31.184 contra $24.865 para as mulheres. A renda per capita para o condado era de $21.879. Cerca de 6,70% das famílias e 8,70% da população estavam abaixo da linha de pobreza, incluindo 15,70% dos menores de 18 anos e 4,40% dos maiores de 65 anos.
O município de Flagler foi classificado como o de maior crescimento no país pelo Departamento do Censo dos EUA de 2000 a 2005, com uma variação de 53,3%, com uma estimativa de população de 76.410 habitantes em 1º de julho de 2005.
