As Primeiras Nações do Canadá viveram em Point Pelee por muito tempo. Isto foi antes dos europeus virem colonizar a área. As pessoas pensam que as pessoas costumavam viver no maior sítio arqueológico que foi encontrado em Point Pelee entre 700 e 900 d.C. Point Pelee foi nomeado por dois sacerdotes em 1670. Eles eram os Padres Dollier e Galinee. A palavra pelée é a palavra francesa para careca.
Os naturalistas e caçadores queriam proteger a área. Eles achavam que a biodiversidade dos vírus precisava de proteção contra o desenvolvimento da terra na área. Antes da criação do parque, foi criado um grupo chamado Sociedade Ornitológica dos Grandes Lagos. Eles estudaram a migração das aves na área. Em 1915, eles recomendaram que Point Pelee se tornasse um parque nacional. Foi o primeiro parque nacional que foi criado para proteger a área. Isso mudou a forma como os parques nacionais foram criados. Quando o parque foi criado, ainda existiam muitas casas de campo na área e dois hotéis. Havia também muitas fazendas e uma escola.
Muitas casas de campo ainda estavam sendo construídas depois que o parque nacional foi criado. Após o acidente de Wall Street de 1929, nenhum terreno do parque foi vendido. O parque tinha um plano de desenvolvimento na década de 1920. Uma rodovia deveria ter sido construída no parque. A partir dos anos 60, muitas pessoas foram para o parque. Point Pelee tornou-se o parque nacional para o qual a maioria das pessoas ia. Quase 781.000 pessoas foram para Point Pelee em 1963. Como muitas pessoas visitaram o parque, grande parte da natureza e da vida selvagem foi destruída. O governo do Canadá disse que Point Pelee não deveria mais ser um parque nacional por causa disso.
Após os anos 80, o governo do Canadá começou a proteger mais a área. Eles deixaram de permitir que os carros conduzissem até a ponta. Em vez disso, eles iniciaram um vaivém até a ponta. Começaram a comprar todas as cabanas do parque e a removê-las. Eles removeram mais de 350 edifícios. Eles também removeram duas estradas. Em 1989, a caça aos patos não era mais permitida no parque. Em 1991, o governo começou a matar alguns dos cervos no parque para proteger as plantas. Eles mataram alguns dos cervos mais algumas vezes depois disso.
Point Pelee se tornou uma reserva do Dark-sky em 2006. Foi o primeiro parque nacional do Canadá a se tornar uma reserva de céu negro. Em 2006, as ondas do Lago Erie lavaram a ponta. Depois disso, em 2007, a ponta reapareceu. Isto se deu porque o nível da água do Lago Erie desceu. A dica muda a cada ano, crescendo mais ou menos. Em 2017, um incêndio em Point Pelee incendiou parte do terreno pantanoso. Cerca de 125 hectares foram incendiados.