A primeira parte do metrô, substituiu uma rota de bondes muito movimentada, e seguiu a Yonge Street da Eglinton Avenue para o sul até a Front Street, depois virou para o oeste por um quarteirão para terminar na Bay Street, ao lado da principal estação ferroviária da cidade, a Union Station e assim a estação de metrô também foi chamada de Union. Esta linha foi terminada em 1954 e tinha 7,4 km de comprimento.
Em 1963 foi acrescentada outra parte, que foi para o norte da estação Union, abaixo da University Avenue e Queen's Park até perto da Bloor Street, onde virou para o oeste para terminar nas ruas St. George e Bloor.
A linha Bloor-Danforth foi aberta em 1966 ao longo da Bloor Street e Danforth Avenue, da Keele Street à Woodbine Avenue, e foi ampliada em 1968 para correr da Islington Avenue até a estação Warden nas avenidas Warden e St.
O encaminhamento da linha através do Vale do Don foi possível devido a uma escolha feita mais de quarenta anos antes. Quando o Viaduto Príncipe Eduardo Eduardo foi construído através do rio Don em 1919, seu projeto incluía dois conveses abaixo da estrada para permitir futuras linhas ferroviárias. Isto tornou possível que o metrô atravessasse o Don Valley até a Avenida Danforth, no lado leste.
A linha Yonge-University foi estendida ao norte de 8,7 km da Eglinton Avenue até Finch Avenue e Yonge em 1973 e 1974.
Mais pista (9,9 km) foi acrescentada à Linha Yonge-University em 1978 quando foi estendida de St. George e Bloor, ao norte e noroeste até Eglinton Avenue e Allen Road, depois ao norte ao longo do meio da Allen Road até Wilson Avenue.
Em outubro de 1976, um incêndio (fogo posto de propósito) destruiu os vagões do metrô e danos à estação Christie. Isto causou o fechamento da Linha Bloor-Danforth por três dias e fechou a estação Christie por algum tempo para reparos. Mais pistas foram acrescentadas em 1980 em ambas as extremidades da Linha Bloor-Danforth. Cada uma destas extensões acrescentou uma estação, baías de ônibus, e, na extremidade leste, espaço para conexão com a Scarborough RT.
Com seis estações em 6,8 km de via, a Scarborough RT é uma linha construída quase toda acima do solo, e que não possui vias diretas que se conectam com as outras linhas e utiliza um trem diferente. Ela utiliza os trens do Sistema de Trânsito de Capacidade Intermediária (ICTS), que são muito diferentes dos trens do metrô. O trajeto é totalmente separado do tráfego rodoviário e de pedestres, as estações são totalmente cobertas e os trens têm muitas portas que utilizam plataformas altas.
Um 1,6 km extra foi adicionado ao extremo norte da parte Spadina da linha Yonge-University-Spadina, adicionando uma estação (Downsview), com estacionamento para ônibus.
Em agosto de 1995, o TTC teve um acidente de metrô muito ruim no que ele chama de acidente de Russell Hill, na linha Yonge-University-Spadina, ao sul da estação St. Três mulheres morreram e 100 pessoas ficaram feridas, umas poucas gravemente.
A mais nova linha do metrô, Sheppard, foi inaugurada em 2002. Ele circula 5,5 km a leste, sob a Avenida Sheppard, da estação Sheppard na linha Yonge (agora chamada Sheppard-Yonge), até a estação Don Mills em Sheppard e Don Mills Road. A linha Sheppard tem menos usuários do que as outras duas linhas de metrô, e nela circulam trens mais curtos.
Em seus mais de 50 anos de história, o primeiro bebê a nascer em uma plataforma da estação de metrô TTC só ocorreu recentemente, em 6 de fevereiro de 2006. Este incidente ocorreu na estação de Wellesley e causou atrasos no sistema do metrô. Foi notícia de primeira página por muitos dias.
Um sistema automático de voz foi adicionado para anunciar cada estação (como; "A próxima estação é Bloor, estação Bloor"), o que acabou com a necessidade de o operador do trem anunciar cada parada. O sistema automatizado é usado em todo o sistema de metrô e RT.
