Hermann Emil Fischer (9 de outubro de 1852 - 15 de julho de 1919) foi um químico alemão que ganhou o Prêmio Nobel de Química em 1902.

Fischer foi o fundador da química de produtos naturais primários: carboidratos, purinas e nucleosídeos, peptídeos e proteínas. Entre suas muitas descobertas estava a estrutura dos carboidratos, e ele foi o primeiro a obter peptídeos sintéticos. Ele estudou os princípios ativos do chá, café e cacau, ou seja, a cafeína e a teobromina.

Fischer também propôs o modelo de chave e fechadura de ação enzimática.