O Dakota viveu em Wisconsin e Minnesota no século XVII. Em 1700 alguns haviam se mudado para o atual Dakota do Sul. No final do século XVII, o Dakota tornou-se uma aliança com comerciantes franceses. Os franceses tentaram usar esta aliança para ajudá-los a controlar o comércio de peles da América do Norte contra os ingleses.
Guerra de Dakota de 1862
No final da década de 1850, as violações de tratados pelos Estados Unidos e os pagamentos injustos por parte de agentes indianos (pessoas do governo que podiam interagir com os nativos) levaram ao aumento da fome e das dificuldades entre os Dakota. Embora o Dakota tenha tentado negociar com o governo dos Estados Unidos, nada foi bem sucedido. Em 16 de agosto de 1862, um grupo de caçadores de Dakota matou uma família de colonos. Isto levou a mais ataques aos colonos, e logo uma guerra total havia começado. Em 5 de novembro de 1862, 38 guerreiros de Dakota foram condenados à morte por enforcamento. Isto se tornaria mais tarde a maior execução em massa da história dos Estados Unidos.
Durante e após a revolta, muitos Dakota do Leste e sua família deixaram Minnesota e Dakota do Leste para ir para o Canadá, ou se estabeleceram no Vale do Rio James em uma reserva de curta duração. Foram então obrigados a se mudar para a Reserva de Crow Creek, na margem leste do rio Missouri. Alguns se juntaram ao Dakota Ocidental e se mudaram para o oeste para ajudar as tribos Lakota a continuar sua luta contra as forças armadas americanas.
Outros permaneceram em Minnesota e no leste, em pequenas reservas que ainda existem, incluindo Sisseton-Wahpeton, Flandreau e Devils Lake (Spirit Lake ou Fort Totten) Reservas nos Dakotas. Alguns se mudaram para Nebraska, onde a Tribo Santee Sioux tem hoje uma reserva na margem sul do rio Missouri.
Aqueles que fugiram para o Canadá deixaram nove pequenas reservas para suas famílias em Manitoba (Sioux Valley, Long Plain, Dakota Tipi, Birdtail Creek, e Oak Lake [Pipestone]) e as outras quatro (Búfalo em pé, Alce Woods [White Cap], Round Plain [Wahpeton], e Wood Mountain) em Saskatchewan.