Drosophila pseudoobscura é uma espécie de mosca-das-frutas, utilizada extensivamente em estudos de laboratório da genética de populações naturais.
Foi usado pela primeira vez por Theodosius Dobzhansky e seus colegas. Eles coletaram amostras de populações na América do Norte ocidental e no México e as cultivaram em "gaiolas populacionais" no laboratório. Eles estavam interessados na seleção natural, na deriva genética e em outros aspectos da genética populacional.
Em 1989, Diane Dodd deu às populações de laboratório de D. pseudoobscura dois tipos diferentes de alimentos, amido e maltose. Eles evoluíram rapidamente em dois grupos distintos após apenas oito gerações com os diferentes alimentos. Como os dois grupos mostraram uma forte preferência pelo acasalamento com seu próprio tipo, isto foi reivindicado como um exemplo de especiação pelo isolamento reprodutivo. A experiência de Dodd foi repetida por outros, e funciona com outros tipos de moscas da fruta e alimentos.
Em 2005, a D. pseudoobscura foi a segunda espécie de Drosophila a ter seu genoma sequenciado, depois da Drosophila melanogaster.

