A Estônia competiu pela primeira vez nos Jogos Olímpicos nas Olimpíadas de Verão de 1920 depois de se tornar independente da Rússia em 1918. O Comitê Olímpico Nacional foi criado em 1923. Eles fizeram parte das primeiras Olimpíadas de Inverno em 1924. Os atletas estonianos participaram dos Jogos Olímpicos até que o país se tornou parte da União Soviética em 1940. Nos Jogos Olímpicos de Verão de 1980, a regata de Vela foi realizada na capital Tallinn. A Estônia participou de todas as Olimpíadas desde que se tornou independente novamente, em 1991. A Estônia conquistou a maioria de suas medalhas em atletismo, halterofilismo, luta livre e esqui cross-country.