As variações intersex ocorrem (embora raramente) em espécies que utilizam a reprodução sexual. As pessoas intersex nascem com características sexuais que se situam entre as dos machos e as das fêmeas típicas. Hermafrodita é um termo que se confunde com intersexual, e enquanto todos os hermafroditas são intersexuais, nem todos os intersexuais são hermafroditas. O termo clínico "distúrbios do desenvolvimento sexual" (DSD) é muito controverso.

A genitália de um indivíduo intersexo pode ser atípica de alguma forma. Pode ser difícil determinar se um bebê intersexo é geneticamente masculino ou feminino (com cromossomos XY ou XX cromossomos). Eles também podem ter características sexuais secundárias masculinas e/ou femininas (como a forma do corpo). Entretanto, há uma ampla gama de variações na anatomia sexual. Há muitas formas mais sutis de anatomia sexual, ou diferenças cromossômicas sexuais. Estas nem sequer se mostram fisicamente. Algumas só aparecerão mais tarde na vida. Algumas vezes, a variação pode aparecer quando o bebê atinge a puberdade ou se torna adulto. Pode até mesmo não ser detectada na vida de um indivíduo, mas à medida que a tecnologia se torna mais avançada, essa chance diminui.