Naruto Uzumaki
O protagonista epônimo que é membro da Equipe 7 e o Jinchuriki de Kurama as Nove Caudas, com ambições de se tornar Hokage para ganhar o respeito dos aldeões e proteger a todos. Ao longo da série, revelou-se descendente de Asura Otsutsuki, cujo chakra e resistência herdou, Naruto é amigo de muitos estrangeiros e Konoha e acaba ganhando um impacto positivo considerável em suas vidas, ao ponto de ganhar fama mundial. Naruto acaba realizando seu sonho de se tornar Hokage e começar uma família com Hinata Hyuga e seus filhos Boruto e Himawari.
Sasuke Uchiha
O deuteragonista da série que é membro da equipe 7 e membro sobrevivente do clã Uchiha, um poderoso clã ninja descendente de Indra Otsutsuki conhecido por seus olhos Sharingan. O único desejo de Sasuke é vingar seu clã, o que, em última análise, o faz virar sobre a Folha Escondida uma vez aprendendo a verdade até a Quarta Grande Guerra Ninja. Pelos acontecimentos do Boruto, perdeu seu braço, Sasuke tornou-se um vigilante errante investigando a influência do clã Otsutsuki sobre o mundo enquanto ajudava Konohagakure.
Sakura Haruno
Um dos amigos de Naruto e membro feminino da Equipe 7, servindo como ninja médica do grupo após ter sido treinado pelo Tsunade. Sakura estava inicialmente apaixonada por Sasuke enquanto ressentia com Naruto, aos poucos vendo este último como um amigo enquanto eventualmente se casava com Sasuke e criava sua filha Sarada.
Kakashi Hatake
O líder e sensei da Equipe 7/Team Kakashi, anteriormente aluno do pai de Naruto, Minato, e adquirindo um sharigan de seu colega de equipe Obito Uchiha. Após a Quarta Grande Guerra Ninja, Kakashi tornou-se o Sexto Hokage e governou Konoha por muitos anos antes de abdicar a favor de Naruto.
Sai
Um ninja que assume o lugar de Sasuke na Equipe Kakashi na Parte II, capaz de dar vida aos seus desenhos. Inicialmente criado para ser um zangão sem emoção pelo supervisor da Fundação Danzo Shimura, Sai começa a se tornar mais social à medida que ele, Naruto e Sakura chegam a um entendimento. No epílogo da série, Sai acaba se casando no Yamanaka e criando seu filho Inojin ao lado de sua esposa Inojin.
Yamato
Um membro da ANBU que se torna um líder secundário da Equipe Kakashi, revelou ter perdido sua identidade original como resultado de Orochimaru experimentando nele quando criança para recriar o estilo de madeira de Hashirama. Devido à posse das células de Hashirama, Yamato provou ser vital ao subjugar as Nove Caudas sempre que Naruto está prestes a ser consumido pelo chakra da besta das caudas.
Vila de Folhas Escondidas
Iruka Umino
Um instrutor da Academia Ninja, que perdeu seus pais para Kurama quando criança, o que o faz sentir-se constrangido por ser professor de Naruto, apesar da decisão do Terceiro Hokage, devido a seus antecedentes semelhantes. Iruka acaba sendo a primeira pessoa a reconhecer Naruto, tornando-se uma figura de pai para o menino.
Konohamaru Sarutobi
O neto do Terceiro Hokage que olha para Naruto como um mentor nesta busca para se tornar Hokage, emulando sua ética de trabalho, determinação e assinatura jutsu como o Rasengan e o Sexy Jutsu entre uma variedade de outras técnicas. Konohamaru insiste, entretanto, que ele só se tornará Hokage depois de Naruto ter sido Hokage primeiro. Pelos acontecimentos do epílogo da série, Konohamaru ascendeu à categoria de jonin e se tornou um mentor para o filho de Naruto, Boruto.
Hinata Hyuga
Um dos amigos de Naruto e membro do clã Hyuga, um poderoso clã ninja descendente de Hamura Otsutsuki conhecido por seus olhos Byakugan. Embora a filha primogênita da casa principal, a timidez e a incapacidade de se impor resultou em sua renúncia por parte de seu pai Hiashi e sua substituição por sua irmã mais nova Hanabi. Hinata foi desde então colocada aos cuidados de Kurenai Yuhi, tornando-se sua aluna gennin ao lado de Kiba Inuzaka e Shino Abarame como membros da Equipe 8. Hinata também desenvolveu gradualmente sentimentos por Naruto, cuja própria determinação a inspirou a ganhar confiança em si mesma, antes de finalmente confessar seu amor por ele. Hinata se casa com Naruto e eles têm dois filhos no epílogo da série.
Equipe Asuma
Anteriormente conhecidos como Equipe 10, eles são compostos pelo filho do Terceiro Hokage Asama Sarutobi e seus três alunos Shikamaru Nara, o rival de Sakura Ino Yamanaka, e Choji Akimichi. Shikamaru e seus amigos também são os atuais herdeiros do moniker "Ino-Shika-Cho", sendo seus clãs aliados próximos. Durante a Parte II, Asuma é morto pelo membro Akatsuki Hidan com Shikamaru vingando seu mentor quando ele se torna o líder do grupo. No epílogo da série, honrando sua promessa de cuidar da filha de Asuma Mirai Sarutobi, Shikamaru e seus amigos, cada um casou e está criando seus filhos Shikadai Nara, Chocho Akimichi e Inojin Yamanaka como o próximo grupo "Ino-Shika-Cho".
Equipe Guy
Uma equipe ninja composta pelo rival de Kakashi Might Guy e seus três alunos Rock Lee, o primo de Hinata, Neja Hyuga, e Tentenário. Eles são um ano mais velhos que o outro gennin da Folha Escondida, pois Guy queria esperar um ano antes que eles pudessem fazer o teste para avançar no posto de ninja e se tornar Chunin. No final da série, Neji se sacrificou para salvar Naruto e Hinata, enquanto o dano circular que Guy levou em seu ataque final o forçou a uma aposentadoria antecipada.
Jiraiya
O mentor de Naruto e um dos Três Lendários Sannin, os estudantes do Terceiro Hokage que ganharam infâmia por sobreviverem ao Hanzo da Salamandra da Chuva Escondida em batalha. Ele também é conhecido como o "Sapo Sábio" por ter aprendido jutsu sábio das Estradas do Monte Myobu, tendo-lhe sido dito pelo mais velho que seu aluno se tornará um salvador do mundo, e também "sábio pervertido" por Naruto por ser o autor abertamente lascivo de uma série de romances românticos para adultos mais vendidos. Ele também escreveu o épico "Conto do Gutsy Ninja", com o nome de Naruto em homenagem a seu protagonista. Durante a Parte I, tomou Naruto como seu aluno antes de deixá-lo na Parte II para investigar o Akatsuki e aprendê-lo a ser liderado por seu ex-aluno Nagato. Jiraiya morre lutando enquanto envia uma mensagem para dar à Folha Escondida uma chance contra Nagato, acreditando que Naruto é o filho da profecia do Sapo Ancião.
Hokage
O termo Hokage refere-se ao título do líder de Konohagakure, com sete no total através da série, cujas semelhanças são desejadas na formação rochosa com vista para Konohagakure.
- Hashirama Senju, o Primeiro Hokage, foi o co-fundador de Konohagakure e o antigo líder do Clã Senju. Tendo vivido em primeira mão o período dos Estados em Guerra em sua infância, Hashirama quis acabar com o conflito e forjou uma amizade com Madara Uchiha antes que a juventude os declarasse inimigos. Mais tarde, Hashirama convenceu Madara a fazer com que seus clãs fizessem a paz enquanto encontravam Konoha. Mais tarde, Hashirama morreu, sendo reanimado duas vezes por Orochimaru através da série.
- Tobirama Senju, o Segundo Hokagem é o irmão mais novo de Hashirama e o professor de Hiruzen Sarutobi que foi creditado como sendo o Hokage que criou a infra-estrutura da Folha Escondida juntamente com vários jutsu que incluem o Shadow Clone Jutsu e a controversa Reanimação Jutsu, a qual ele acabou sendo submetido por Orochimaru.
- Hiruzen Sarutobi, o Terceiro Hokage, é o primeiro Hokage introduzido na série. Ao longo da série, ele atua como uma fonte de sabedoria para as gerações mais jovens; e desde o início, é um dos poucos personagens a tratar Naruto como uma pessoa e não como um jinchuriki. Ele também é o mentor do Lendário Sannin, sendo morto por seu aluno traiçoeiro enquanto usava o Selo da Morte do Ceifador para prender sua alma e seus três antecessores no estômago do Ceifador juntamente com parte da alma de Orochimaru. Durante a Quarta Grande Guerra Ninja, Orochimaru liberta a alma de Hiruzen do Selo da Morte e o reanima para que Sasuke possa confirmar os eventos por trás do Massacre do Clã Uchiha. Mais tarde, ele participa da batalha contra Obito e Madara ao lado do outro Hokage ressuscitado, antes de ser colocado em repouso após a derrota de Kaguya.
- Minato Namikaze, o Quarto Hokage, é o pai de Naruto Uzumaki que também é professor de Kakashi e o aluno de Jiraiya que aperfeiçoou o teletransporte do Deus Trovão Voador Jutsu de Tobirama. Antes do início da série, depois de combater Tobi, Minato sifona o chakra Yin de Kurama para enfraquecer a besta a ser selada no corpo de Naruto em um ato de sacrifício para que somente seu filho possa acessar o chakra yang de Nine-Tails. Reanimado anos depois como um Jinchuriki de Nove Caudas por Orochimaru, Minato se reuniu com Naruto e eventualmente transferiu o chakra yin de Nove Caudas para seu filho antes de retornar à vida após a morte.
- Tsunade, o Quinto Hokage, é o Hokage da maior parte da série, sendo uma aparência do Terceiro Hokage e membro do clã Senju através de seu avô Hashirama que possui uma força sobre-humana e usa uma técnica de transformação para manter sua aparência jovem. Tsunade inicialmente não queria nenhum envolvimento com o Hokage, pois seu irmão mais novo Nawaki e seu namorado Dan Kato morreram ambos com esse sonho. Mas recupera sua fé após conhecer Naruto Uzumaki e se torna Hokage enquanto passa suas habilidades para Sakura e Ino. Ao final da série, Tsunade se aposenta no final da Quarta Grande Guerra Ninja e concede o título de Hokage a Kakashi.
Danzo Shimura
Um residente de Folha Escondida que é o líder da Fundação, uma organização secreta que supervisiona secretamente a segurança de sua aldeia junto com seu objetivo pessoal de se tornar um Hokage. Tendo considerado Hiruzen e seus sucessores de mente fraca, a ação de Danzo causou inúmeros eventos que incluem o Massacre de Uchiha, recrutando Orochimaru para aumentar seu enxerto de braço direito com múltiplos olhos Sharingan e as células de Hashirama. Embora Danzo tenha sido nomeado Candidato Interino Sexto Hokage durante o coma do Tsunade, ele acaba sendo fatalmente ferido por Sasuke com sua morte, levando à dissolução da Fundação após a Quarta Grande Guerra Ninja.
Antagonistas
Zabuza Momochi
Um dos primeiros adversários de Naruto e ex-membro dos Sete Espadachins da Névoa Escondida, um grupo de ninjas que usam espadas particularmente grandes em batalha. Infame por abater toda a sua classe como parte de um ritual de graduação, Zabuza possui uma grande espada chamada Lâmina do Executor que pode se reparar absorvendo o ferro do sangue. Zabuza e seu aprendiz Haku, um possuidor do Kekkei Genkai estilo gelo, acabam se tornando ninjas vilões após um golpe de estado fracassado do Quarto Mizukage e se tornam assassinos mercenários para financiar outra tentativa sob o emprego de um chefe do crime chamado Gato. Mas o encontro com a Equipe 7, e ser traído por Gato, resultou na morte de Zabuza quando ele e Haku foram reanimados por Kabuto durante a Quarta Grande Guerra Ninja.
Orochimaru
Um criminoso que serviu como o principal vilão da Parte I, o estudante traiçoeiro de Hiruzen que anteriormente se juntou ao Akatsuki e se associou a Danzo. O desejo de Orochimaru de imortalidade para que ele pudesse aprender todos os justu's existentes o levou a fazer experiências com seus companheiros ninjas antes de estabelecer sua própria aldeia ninja, a Vila do Som Escondido, como seu laboratório pessoal para continuar seu trabalho enquanto reunia um exército pessoal para destruir Konoha com ele. Sua técnica de imortalidade envolve a transferência de sua consciência entre diferentes corpos anfitriões a cada poucos anos, sendo sua intenção de adquirir o corpo de Sasuke Uchiha suas motivações de condução durante a maior parte da série. Após o final da Parte II, através da vigilância de Yamato, Orochimaru renunciou a sua guerra pessoal contra a Vila das Folhas Escondidas enquanto criava Mitsuki.
Kabuto Yakushi
Orochimaru tem a mão direita e espionagem, sendo proficiente o suficiente em ninjutsu médico para manipular células. Kabuto foi inicialmente um infiltrado da Fundação que não tinha nenhuma memória de seu passado e levado por Orochimaru quando Danzo o considerava um risco de segurança, Kabuto usa suas habilidades para reunir informações sobre vários grupos em nome de Orochimaru. Depois que Orochimaru foi subjugado, Kabuto decide tornar-se mestre de seu destino dominando o jutsu da cobra Sábia enquanto integra alguns dos restos mortais de Orochimaru em seu corpo junto com amostras de DNA do Sound Five, Jugo, Suigetsu e Karin. Kabuto também aperfeiçoa o Jutsu de Reanimação, forçando uma aliança com Tobi e Sasuke como pagamento por suas superfícies. Mas Kabuto acaba sendo derrotado e reavaliando suas escolhas de vida ao decidir salvar Sasuke. No rescaldo da guerra, mantido sob a vigilância da Folha Escondida, Kabuto voltou para dirigir o orfanato onde estava preso quando era criança, junto com seu irmão adotivo Urushi.
Itachi Uchiha
Um ninja rouge de Folha Escondida que se uniu aos Akatsuki após o abate de seu clã, tendo sido retratado como um vilão. Mas após a morte, Itachi se revela leal à Folha Escondida e só matou sua família, tornando-se ameaçado de tentar um golpe de estado sob ordem de Danzo com a ajuda de Tobi. Itachi aceita a tarefa na condição de que Sasuke seja poupado, tendo planejado fazer com que Sasuke o matasse. Itachi mantém sua lealdade à Folha Escondida espionando secretamente a Akatsuki, sendo associado de Kisame enquanto membro.
Akatsuki
A principal força antagônica da segunda parte da série Naruto, foi fundada pelos estudantes de Jiraiya Yahiko, Nagato e Konan como um grupo de manutenção da paz na Chuva Escondida antes de uma tragédia orquestrada por Danzo permitir que Tobi a rebatizasse como mercenários contratados, comprometidos com os ninjas malfeitores. O Akatsuki, com Nagato agora um líder figurativo assumindo que seu objetivo é forçar todos a entender o sofrimento em nome da verdadeira paz, atua no Projeto Tsuki no Me (Olho da Lua) de Madara para alimentar as bestas caídas na Estátua de Gedo e lançar um Tsukiyomi Infinito para subjugar toda a humanidade.
- Nagato, conhecido principalmente por seu pseudônimo Pain com os olhos de Madara implantados nele quando era criança, é a figura de Akatsuki e sócio da Konan. A "Dor" que é mais freqüentemente vista na série e utilizada é o Deva Path, que na verdade é o cadáver do falecido amigo de Nagato Yahiko, que foi o líder fundador da Akatsuki com eles e Konan sendo órfãos de guerra que aprenderam ninjutsu de Jiraiya. Depois de ser aleijado após a morte de Yahiko, Nagato usa seis corpos modificados conhecidos como os Seis Caminhos da Dor como substitutos, cada um usando um sexto de seu poder total. Depois de matar Jiraiya, Nagato liderou um ataque à Folha Escondida com Naruto derrotando seus Caminhos e conseguindo restaurar a fé de Nagato nos ensinamentos de Jiraiya ao sacrificar-se para usar um jutsu Tobi destinado à ressurreição de Madara. Tobi profanou mais tarde o lugar de descanso de Nagato para adquirir o Rinnegan, que Madara mais tarde recuperou, com Kabuto reanimando Nagato para a Quarta Grande Guerra Ninja antes de ser selado por Itachi.
- Konan, o único membro feminino de Akatski e amigo de infância de Nagato. Enquanto sob Jiraiya, Konan aprendeu a aproveitar seu talento natural com origami, usando-o como um componente chave em seu estilo de luta. Após a morte de Nagato, Konan retira sua posição de Akatsuki e mais tarde luta contra Tobi quando ele vem pelos olhos de Rinnegan, acabando morta após o fracasso de sua agressão suicida.
- Kisame Hoshigaki, um ninja velhaco da Vila da Névoa Escondida que é parceiro de Itachi Uchiha. Como um dos Sete Espadachins da Névoa, Kisame usa uma espada viva em escala chamada Sharkskin que absorve quantidades incalculáveis do chakra de um oponente e a transfere para Kisame para lhe dar uma quantidade infinita de resistência. Sua razão de se juntar aos Akatsuki foi ver um mundo sem mentiras, indo mais tarde atrás da Abelha Assassina antes de sua missão mudar para infiltração antes de cometer suicídio ao ser capturado enquanto enviava a localização dos jinchurikis para Tobi.
- Sasori, um ninja fantoche de Areia Escondida, conhecido como "Sasori da Areia Vermelha" devido ao seu talento na fabricação de venenos. Criado por sua avó Chiyo depois que seus pais foram mortos pelo pai de Kakashi Sakumo Hatake, a obsessão de Sasori em fazer coisas que duram para sempre lhe permitiu desenvolver um meio de converter cadáveres humanos em marionetes cujas habilidades na vida ele pode usar. Sasoei deixou sua aldeia, raptando o Terceiro Cazaquistão e o transformou em sua arma principal depois de ter lacrado sua areia de ferro com veneno. Mais tarde Sasori converteu seu próprio corpo em um fantoche que esconde em seu corpo blindado o fantoche Hiruko, tornando-se essencialmente mortal enquanto controla centenas de fantoches de uma só vez. Depois de se juntar ao Akatsuki, Sasori foi emparelhado com Orochimaru e depois Deidara enquanto eles capturam Gaara para que a Cauda Única possa ser extraída dele. Mas Sasori acaba sendo morto, seu corpo de boneco usado por Kankuro.
- Deidara, uma ninja de Pedra Escondida vilã que ganhava a vida como terrorista bombardeiro por encomenda com seus explosivos de argila antes de Itachi Uchiha forçá-lo a se juntar ao Akatsuki. Embora ele tenha vindo para abraçar a organização, em parceria com Sasori e depois Tobi, Deidara desenvolveu um rancor contra o clã Uchiha em geral ao sentir que seus olhos Sharingan olham para baixo em sua obra de arte. Depois de desempenhar um papel na captura de Gaara e na captura dos Três Caudas, Deidara luta contra Sasuke e acaba explodindo em uma tentativa final de matar seu oponente. Deidera é mais tarde reanimada por Kabuto durante a Quarta Grande Guerra Ninja antes de ser derrotada por Kankuro.
- Hidan, um ninja sadomasoquista de rouge da Hidden Boiling Water Village, armado com uma foice e parceiro de Kakuzu. Como membro de um culto à morte conhecido como o Caminho de Jashin, Hidan tornou-se imortal enquanto desenvolvia técnicas ritualistas que lhe permitiam assassinar seu oponente infligindo ferimentos fatais a si mesmo. Hidan tornou-se um inimigo de Shikamaru após assassinar Asama, acabando por ser desmembrado e enterrado na floresta da família Nara.
- Kakuzu, um ninja rouge da Vila da Cachoeira Escondida e parceiro da Hidan. Tendo vivido durante o tempo do Primeiro Hokage, Kakuzu dominou um jutsu proibido que faz com que seu corpo seja mantido junto por ameaças negras e assimilar até cinco corações para prolongar sua vida indefinidamente. Enquanto a ganância o fez servir como tesoureiro do Akatsuki e caçador de recompensas, ele matou a maioria de seus parceiros antes de ser emparelhado com o imortal Hidan. Os corações de Kakuzu são sistematicamente destruídos durante sua luta contra o ninja da Folha Escondida, com Kakashi acabando com ele depois que Naruto deixa seu coração final à beira do fracasso. Kakuzu é mais tarde reanimado durante a Quarta Grande Guerra Ninja, antes de ser selado.
Obito Uchiha
Também conhecido como Tobi, ele é o verdadeiro líder da Akatsuki como antagonista principal durante a maior parte da Parte II. Similar a Naruto quando criança durante a Terceira Grande Guerra Ninja, ele deu seu olho esquerdo para seu colega de equipe Kakashi quando parecia que ele estava prestes a morrer. Apesar de sua aparente morte, Obito foi salvo por Madara que substituiu as partes danificadas de seu corpo por próteses Zetsu enquanto o condicionava a se tornar seu aprendiz, o ninja arranjando Obito para testemunhar a morte de Rin Nohara como uma baixa de guerra por um Kakashi relutante em quebrar seu espírito. Chegando à conclusão de que ele pode usar as Bestas Tailed para destruir a realidade atual e criar uma utopia, Obito retoma o nome de Madara e manipulou eventos que permitiram a criação da corrente dos Akatsuki e o ataque dos Nove Caudas à Aldeia das Lamentações, por despeito ao seu antigo mentor Minato. Além de poder usar seu Sharingan direito para manipular Kamui de uma forma que fez parecer que ele é intangível e se teletransportar por grandes distâncias, Obito pode usar ataques do estilo Wood Style, pois suas próteses possuem as células de Hashirama. Após ser derrotado e sua fé no mundo restaurada, recuperando o Sharingan que ele deu a Kakashi, Obito morre protegendo a equipe 7 de Kaguya e permanece entre os vivos o tempo suficiente para ajudar Kakashi em espírito.
Madara Uchiha
Um dos co-fundadores da Vila das Folhas Escondidas ao lado de seu amigo de infância e inimigo mortal Hashirama Senju, os dois mais tarde revelaram ser reencarnações dos ancestrais fundadores de seus clãs Indra e Asura antes de Sasuke e Naruto. Madara é um cínico vingativo e arrogante que se ressentiu dos Senju por matar seus irmãos durante o Período dos Estados em Guerra, acabando por aceitar a oferta de paz de Hashirama antes de eventualmente ficar desiludido com ele, pois percebeu que não tinha lugar na Vila de Folha Escondida. Isto influenciou Madara a tentar destruir a Folha Escondida com as Nove Caudas antes de ser derrotado por Hashirama, fingindo sua morte e usando o sangue de Hashirama para despertar seu Rinnegan e convocar a Estátua de Gedo para prolongar sua vida. Madara eventualmente morre após fazer Obito Uchiha como seu agente, tendo transplantado seu Rinnegan para Nagato para ser preservado para sua ressurreição planejada. Apesar de alguns contratempos, Madara ressuscita e se transforma no jinchuriki Ten Tails para realizar seu plano antes de ser traído pelo Black Zetsu e transformado em um recipiente para Kaguya. Apesar de libertado ao Kaguya ser novamente selado, a provação colocou uma Madara arrependida à beira da morte e morre finalmente fazendo as pazes com Hashirama.
Kaguya Otsutsuki
O antagonista central subjacente da série Naruto e membro da família principal do clã Otsutsuki, uma raça de ninjas alienígenas cujos descendentes da família do ramo incluem os Senju, os Uchiha, e os Hyuga. Tendo decidido proteger o mundo em vez de alimentá-lo como seu parente, Kaguya torna-se uma extensão da Árvore Divina do mundo ao estabelecer seu ideal de paz mundial. Mas Kaguya acaba perdendo a confiança na humanidade ao converter alguns humanos assimilados pela Árvore Divina em seu exército pessoal de Zetsu Branco como defesa contra seus parentes, levando-a a um confronto com seus filhos gêmeos meio-humanos Hagoromo e Hamura ao saber que eles herdaram seu chakra. Kaguya acabou se fundindo na Árvore Divina e a transformando em Ten-Tails antes de ser selada na lua quando capturada por Hagoromo e reduzida à estátua de Gedo em forma de cadáver, enquanto seu chakra extraído é fragmentado nas nove Bestas Tailed. Mas Kaguya criou o Black Zetsu no último segundo para orquestrar seu retorno através da Indra e do Clã Uchiha, com Madara Uchiha acabando por se tornar sua embarcação uma vez cumprindo seu propósito. Mas Naruto e Sasuke, com a ajuda de sua equipe, conseguiram resselar Kaguya com as bestas das caudas e Madara extraída de seu corpo.
- Zetsu, o único membro desumano da Akatsuki que serve como espião e encarregado de dispor dos membros falecidos da Akatsuki ou daqueles que a organização não quer que sejam encontrados. Zetsu é na verdade composto por dois seres, sendo o primeiro um simbionte sombra conhecido como Zetsu Negro, criado por Kaguya para manipular seu neto Indra e seus descendentes antes de Madara manifestar um Rinnegan para servir como meio de libertar Kaguya. O Zetsu Negro fingiu a construção de Madara enquanto estava ligado a um Zetsu Branco, um dos milhares de ex-humanos que haviam sido assimilados dentro da Estátua de Gedo como soldados zangões de plantas. Depois que o Zetsu Branco é morto por Sasuke durante a Quarta Grande Guerra Ninja, o Zetsu Negro eventualmente se agarra ao Obito e depois a Madara antes de ser selado com Kaguya.
- Tobi, também conhecido como "Gurguru", é um Zetsu Branco que serviu como exosqueleto de Obito enquanto lidava com seu novo corpo e serviu de inspiração para o disfarce Tobi de Obito. Tobi participa da Quarta Grande Guerra Ninja enclausurando Yamato para acessar seu estilo Wood-Style antes de ejetá-lo uma vez que Madara consegue fundir o Infinito Tsukiyomi, é visto pela última vez desmoronando depois que o jutsu é cancelado com seu antigo cativo, a única testemunha de sua morte.
