A terra ao redor do lago é o lar da tribo Thao. Eles são um povo aborígine. Segundo a lenda, os caçadores Thao descobriram o Lago Sun Moon depois de perseguir um veado. O veado os conduziu até o lago. Eles descobriram que o lago era lindo e tinha muitos peixes. Uma ilha no meio do lago é considerada como o lugar de culto do povo Thao.
No passado, o lago era chamado de Lago Candidius. Foi nomeado em homenagem ao missionário Georgius Candidius. O lago foi chamado pela primeira vez de Lago Sun Moon em 1821, em um livro chamado Travels to Shueilishe, de Deng Chuan-an. Na dinastia Qing, os chineses começaram a se mudar para a área ao redor do Lago Sun Moon. Muitas pessoas queriam abrir restaurantes, hotéis e lojas lá.
Quando Taiwan foi governado pelo Japão, eles fizeram muitas mudanças. As primeiras usinas elétricas foram construídas em 1934. Estava sendo construída há 15 anos e o projeto começou em 1919. A ferrovia da Linha Jiji foi construída para ajudar na construção das usinas elétricas. A Ilha Lalu foi renomeada "Ilha de Jade". Os japoneses construíram uma grande barragem em 1931 que tornou o lago muito maior. Em 1946, o novo governo chinês renomeou o lago de "Ilha Kuanghua". O nome permaneceu assim até o terremoto de 921 em 1999 que danificou a ilha. Após o terremoto, a ilha foi renomeada Ilha Lalu. Foi renomeada porque o governo de Taiwan queria ajudar a preservar a cultura tailandesa.
Em 1967, foi criado um Centro de Cultura Aborígene para ajudar a preservar a cultura tailandesa. Em 1975, o centro foi inaugurado. Em 1990, um iate virou de cabeça para baixo enquanto estava na água. Ele causou a morte de 57 pessoas. Apenas 25 pessoas sobreviveram. Em 2012, uma imagem do Lago Sun Moon foi usada nos passaportes da República Popular daChina. Isso irritou o governo taiwanês porque dizem que Taiwan e Sun Moon Lake não fazem parte da República Popular da China.