A aeronave do vôo 11 da American Airlines era um Boeing 767. Embora pudesse transportar 158 passageiros, o vôo 11 de setembro transportava apenas 81 passageiros e 11 membros da tripulação. Voando a aeronave estava o piloto John Ogonowski e o primeiro oficial Thomas McGuinness. As assistentes de bordo foram Barbara Arestegui, Jeffrey Collman, Sara Low, Karen Martin, Kathleen Nicosia, Betty Ong, Jean Roger, Dianne Snyder e Madeline Sweeney.
Embarque
Mohamed Atta, membro do grupo terrorista Al-Qaeda e líder dos ataques, e outro sequestrador, Abdulaziz al-Omari, voaram juntos de Portland, Maine, para Boston no início de 11 de setembro de 2001. Ambos os sequestradores tinham bilhetes de primeira classe para um vôo para Los Angeles, Califórnia. Três outros seqüestradores, Waleed al-Shehri, Wail al-Shehri e Satam al-Suqami chegaram ao Aeroporto Internacional de Logan de carro. Todos os cinco fizeram o check-in e, às 07h40, estavam a bordo da aeronave que deveria partir às 07h45.
Mohamed Atta sentou-se em classe executiva com Abdulaziz al-Omari e Suqami. Waleed al-Shehri e Wail al-Shehri sentaram-se em primeira classe. A aeronave taxou para longe do portão 26 e partiu do Aeroporto Internacional de Logan às 07:59 da pista 4R, após um atraso de 14 minutos.
Seqüestro
Pensa-se que o Highjacking do avião começou às 08:14. Isto foi quando o piloto e o primeiro oficial pararam de falar com o controle de tráfego aéreo em Boston. Dois minutos depois, a aeronave parou de voar ao longo da rota em que deveria voar. Nenhuma outra resposta de rádio veio da aeronave e o sistema da aeronave usado para evitar o choque com outras aeronaves também foi desligado. Os comissários de bordo Ong e Sweeney contataram a American Airlines com telefones AT&T durante o seqüestro. Eles disseram que os sequestradores haviam ferido dois dos outros atendentes e matado um passageiro israelense. Durante a longa chamada de quatro minutos, Ong disse à companhia aérea em que assentos os sequestradores estavam sentados e disse que ninguém podia entrar no cockpit.
Às 08:23:38, Atta tentou falar com os passageiros do cockpit, mas apertou o botão errado e enviou a mensagem para o controle de tráfego aéreo. Ele disse que "[Eles] têm alguns aviões, basta ficar quieto e você ficará bem". Vamos voltar para o aeroporto". Um minuto depois ele disse: "[Ninguém se mexe]. Tudo vai ficar bem. Se você tentar fazer qualquer movimento, você colocará em perigo a si mesmo e ao avião. Fique quieto". O controle de tráfego aéreo percebeu que a aeronave havia sido sequestrada e chamou a Administração Federal de Aviação. Logo depois, Atta anunciou "Ninguém se mexa, por favor, vamos voltar para o aeroporto, não tente fazer nenhum movimento estúpido". Cinco minutos depois, o controle de tráfego aéreo de Boston chamou o Comando de Defesa Aeroespacial da América do Norte (NORAD). O NORAD ordenou que dois aviões de caça F-15 pegassem o vôo, mas era tarde demais-AA 11 já havia feito sua última curva em direção a Manhattan e caiu na Torre Norte do World Trade Center mais de seis minutos antes que o avião de caça tivesse decolado.
Crash
Às 08:46:40, os sequestradores despenharam o vôo 11 no lado norte da Torre Norte (Torre 1) do World Trade Center. A aeronave, viajando a cerca de 466 milhas por hora (750 km/h) e carregando cerca de 10.000 galões de combustível inflamável, caiu entre o 93º e 99º andares da Torre Norte. No total, 92 pessoas a bordo foram mortas.
Como a Torre Norte estava tão danificada, as pessoas não podiam escapar de cima onde a aeronave havia caído. Todas as escadas e elevadores do 92º andar para cima estavam bloqueados, prendendo 1.344 pessoas. Centenas de pessoas foram mortas imediatamente pelo impacto. Os demais ou ficaram presos e morreram devido ao incêndio e à fumaça ou ao colapso da torre. Alguns morreram depois de terem saltado do edifício. Mais de um eixo de elevador levou o combustível queimado para baixo, explodindo no caminho para baixo.
Jules Naudet, um cameraman francês filmou o acidente. Uma webcam montada em uma exposição de arte no Brooklyn para tirar fotos da Lower Manhattan, a cada quatro segundos, também filmou o vôo 11 colidindo com a Torre Norte.
As organizações noticiosas relataram pela primeira vez uma explosão no World Trade Center. A CNN interrompeu um comercial às 08:49 com a manchete que dizia "Desastre no World Trade Center". O presidente George W. Bush estava chegando a uma escola primária em Sarasota, Flórida, quando foi informado sobre o desastre. O presidente disse: "Este é um erro piloto". É inacreditável que alguém fizesse isso". O cara deve ter tido um ataque cardíaco". As primeiras notícias acreditavam que o acidente tinha sido um acidente até que o vôo 175 bateu na Torre Sul às 09:03.
