Matthew Stanley Meselson (nascido em 24 de maio de 1930) é geneticista e biólogo molecular da Universidade de Harvard. Ele é conhecido por sua demonstração, com Franklin Stahl, da replicação semi-conservadora de DNA.
Após completar seu doutorado sob Linus Pauling no Instituto de Tecnologia da Califórnia, Meselson tornou-se professor na Universidade de Harvard em 1960. Ele está lá hoje como Thomas Dudley Cabot Professor de Ciências Naturais.
Na famosa experiência Meselson-Stahl de 1958, ele e Frank Stahl mostraram com a etiquetagem de isótopos de nitrogênio que o DNA é reproduzido de forma semi-conservadora. Além disso, Meselson, François Jacob e Sydney Brenner descobriram a existência do RNA do mensageiro em 1961. Meselson investigou a reparação do DNA nas células e como as células reconhecem e destroem o DNA estranho e, com Werner Arber, foi responsável pela descoberta das enzimas de restrição.
Desde 1963 ele está interessado na guerra química e na defesa biológica e no controle de armas. Meselson trabalhou com Henry Kissinger sob a administração Nixon para convencer o presidente Richard Nixon a renunciar às armas biológicas, suspender a produção de armas químicas e apoiar um tratado internacional de proibição de agentes biológicos para fins hostis. Em 1972, isto se tornou a Convenção sobre Armas Biológicas.
Meselson tem recebido muitos prêmios. Seu laboratório em Harvard investiga a natureza biológica e evolutiva da reprodução sexual, da recombinação genética e do envelhecimento. Muitos de seus ex-alunos são biólogos notáveis, incluindo o Prêmio Nobel Sidney Altman, Mark Ptashne, Susan Lindquist, Stephen F. Heinemann e Richard I. Morimoto.