Os Archamoebae são um grupo importante de amoebae. Elas são incomuns entre os artistas porque não têm mitocôndrias.
O grupo inclui muitos gêneros que são parasitas internos ou comensais de animais: por exemplo, Entamoeba e Endolimax. Alguns são patógenos humanos, causando doenças como a disenteria amebica. Outros gêneros de arquamoebae vivem em habitats de água doce e têm flagelos. A maioria tem um único núcleo e flagelo, mas a gigante ameba Pelomyxa tem muitos de cada um.
A análise de 100 genes mostra que os Archamoebae são parte dos Amoebozoa que perderam suas mitocôndrias. Eles são parentes próximos dos moldes de lodo. Formas parasitárias e comensais como Entamoeba e Endolimax se desenvolveram separadamente dos ancestrais de vida livre.