O sistema Macquarie cobre uma área de mais de 74.000 quilômetros quadrados. Mais de 72% do terreno é plano, e 17% é montanhoso. O resto é íngreme a montanhoso, chegando a 900 metros. A fronteira leste é formada pela Grande Cordilheira Divisória, desde perto de Oberon, no sul, até Coolah, no norte. Um cume de montanha vai para noroeste a partir da Grande Cordilheira Divisória por cerca de 400 quilômetros, depois a fronteira vira para norte.
De Bathurst, perto do início do rio, passa pelas seguintes áreas geográficas:
- as planícies de Bathurst, país ondulado a cerca de 700 metros acima do nível do mar cercado por altas planícies de mesa em todos os lados. Isto inclui uma grande planície de inundação ao redor de Bathurst
- o planalto de Hill End Plateau, onde é unido a partir do leste pelo rio Turon. O Turon drena um platô que se estende das proximidades de Portland até Sofala. Esta área fica a cerca de 1100 metros acima do nível do mar no sul e 700 metros no norte. A área é principalmente de encostas montanhosas escarpadas.
- Barragem de Burrendong, o rio Macquarie é unido a partir do leste pelo rio Cudgegong. Este sobe nas colinas ao redor de Rylstone a cerca de 700 metros acima do nível do mar.
- através de Wellington e Dubbo, o rio é unido pelos Rios Sino e Pequeno. O rio Bell se eleva em país plano a ondulado do planalto de Orange, cerca de 900 metros acima do nível do selo. O ponto mais alto é o extinto pico vulcânico do Monte Canobolas, que fica a 1.400 metros acima do nível do mar. Entre Wellington e Dubbo, grandes áreas planas são evidentes.
- ao norte de Dubbo, o rio Talbragar une-se ao Macquarie. O Talbragar é o tributário mais importante a jusante. Este rio nasce em país montanhoso na junção da Grande Cordilheira Dividida com a Cordilheira Warrumbungle. O país por onde corre o rio Talbragar é amplo e plano, delimitado por colinas onduladas que se tornam menores conforme o rio se aproxima de Dubbo.
- Ao norte de Dubbo, o rio passa por planícies planas que correm para noroeste através de Narromine e Warren. Uma série complexa de riachos ligando os rios Macquarie, Darling e Bogan.
- Macquarie Marshes estão no final do canal do rio propriamente dito. Perto de Carinda, o Macquarie é unido pelo riacho Marthaguy que drena uma área de 6.500 quilômetros quadrados e transporta água de inundação dos rios Macquarie e Castlereagh.
A precipitação varia na área drenada pelo rio Macquarie. A montanha, os picos e as planícies recebem maior precipitação devido ao efeito de sombra das cordilheiras circundantes. A área da Grande Cordilheira Divisória recebe entre 750 a 900 mm de precipitação média anual. Esta queda é uniforme durante todo o ano. As falhas na Grande Cordilheira Divisória permitem que o ar úmido do leste passe para o interior, a precipitação mediana anual de 750 mm ou mais é experimentada mais para o oeste. Mais ao noroeste é mais seco, nos vales de Castelreagh e porções médias dos Macquarie, a precipitação média anual é de 300 a 400 mm.
A precipitação pode variar drasticamente ao longo de vários anos. Os registros mostram que a precipitação pode ser de 200% ou menos de 50% do valor médio anual. A evaporação varia de menos de 1000 mm a sudeste de Bathurst até mais de 2000 mm em Bourke.
