Um núcleo em anatomia é uma estrutura cerebral (plural = núcleos). É um conjunto compacto de neurônios. É uma das duas formas mais comuns de organização das células nervosas, sendo a outra estruturas em camadas como o córtex cerebral ou o córtex cerebelar. O mesmo tipo de estrutura no sistema nervoso periférico é chamado de gânglio. Alguns dos nomes tradicionais para núcleos cerebrais também usam essa palavra.
Nas seções anatômicas, um núcleo aparece como uma região de matéria cinzenta, muitas vezes bordejada de matéria branca. O cérebro vertebrado contém centenas de núcleos, que variam em forma e tamanho. Um núcleo pode ter uma estrutura interna complexa, com vários tipos de neurônios dispostos em tufos (sub-núcleos) ou camadas.