A respiração difere entre as espécies de salamandras. Espécies que não possuem respiração pulmonar através das brânquias. Na maioria dos casos, estas são brânquias externas, visíveis como tufos em ambos os lados da cabeça, embora os amphiumas tenham guelras internas e guelras cortadas. Algumas salamandras que são terrestres têm pulmões que são usados na respiração, embora estes sejam simples e semelhantes a sacos, ao contrário dos órgãos mais complexos encontrados nos mamíferos. Muitas espécies, como o olmeiro, têm tanto os pulmões quanto as brânquias como adultos.
Algumas espécies terrestres carecem de pulmões e brânquias e realizam trocas gasosas através de sua pele, um processo conhecido como respiração valeriana no qual os leitos capilares são espalhados por toda a epiderme, e dentro da boca. Mesmo algumas espécies com pulmões também podem respirar através da pele desta maneira.
A pele das salamandras segrega o muco. Isto ajuda a manter o animal úmido quando em terra seca, e mantém seu equilíbrio de sal enquanto em água, além de fornecer um lubrificante durante o banho. As salamandras também secretam veneno das glândulas em sua pele, e algumas adicionalmente têm glândulas de pele para secretar feromonas de corte.
A caça é ainda outro aspecto único das salamandras. Nas salamandras sem sabão, os músculos ao redor do osso hióide se contraem para criar pressão e realmente "disparam" o osso hióide para fora da boca junto com a língua. A ponta da língua é composta de um muco que cria uma extremidade pegajosa para a qual a presa é capturada. Músculos na região pélvica são usados para enrolar a língua e o osso hióide de volta à sua posição original.
Muitas das espécies altamente aquáticas, porém, não têm músculos na língua, e não a utilizam para capturar presas, enquanto a maioria das outras espécies tem uma língua móvel, mas sem as adaptações no osso hióide. A maioria das espécies de salamandra tem dentes pequenos tanto na mandíbula superior quanto na inferior. Ao contrário das rãs, até mesmo as larvas das salamandras possuem esses dentes.
Para encontrar suas presas, as salamandras utilizam a visão tricromática das cores na faixa ultravioleta. As salamandras subterrâneas permanentes têm olhos reduzidos, que podem até ser cobertos por uma camada de pele. As larvas, e os adultos de algumas espécies altamente aquáticas, também possuem um órgão de linha lateral, semelhante ao dos peixes, que pode detectar mudanças na pressão da água. As salamandras não têm orelha externa, e apenas uma orelha média vestigial.
Os salamandras podem soltar sua cauda para escapar dos predadores. A cauda cairá e se mexerá por um pouco, e os salamandras fugirão ou ficarão quietos o suficiente para não serem notados enquanto o predador estiver distraído. As salamandras regeneram rotineiramente tecidos complexos. Em apenas algumas semanas após a perda de um pedaço de membro, uma salamandra reforma perfeitamente a estrutura em falta.
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