"Owen: o mais ilustre zoólogo e paleontólogo vertebrado... mas um homem muito enganador e odioso". Richard Broke Freeman (Charles Darwin: um Companheiro. Dawson 1978)
Owen creditou-se e Georges Cuvier com a descoberta do Iguanodon, excluindo completamente qualquer crédito pelo descobridor original do dinossauro, Gideon Mantell. Esta não foi a primeira ou última vez que Owen reivindicou deliberadamente uma descoberta como sendo sua, quando na verdade não foi. Owen foi finalmente demitido do Conselho Zoológico da Royal Society por plágio.
Owen foi altamente crítico em relação a Darwin's On the Origin of Species, em parte porque Darwin não se referia muito às teorias científicas anteriores sobre a evolução. Em vez disso, Darwin comparou a teoria da evolução por seleção natural com a teoria não-científica da Bíblia.
Owen, na opinião de Darwin, foi "Triste, extremamente maligno, inteligente; os londrinos dizem que ele é louco de inveja porque meu livro é tão falado". "É doloroso ser odiado no grau intenso com que Owen me odeia".
Owen também foi parte da ameaça de acabar com o financiamento governamental do Royal Botanic Gardens, coleção botânica Kew (ver Joseph Dalton Hooker):
"Na raiz estava o sentimento de Owen de que Kew deveria estar subordinado ao Museu Britânico (e a Owen) e não deveria ser permitido desenvolver-se como uma instituição científica independente com a vantagem de um grande jardim botânico".
Na primeira parte de sua carreira, Owen foi considerado corretamente como uma das grandes figuras científicas da época. Na segunda parte de sua carreira, sua reputação escorregou. Isto não se deveu apenas ao seu trato desleal com os colegas; foi também devido aos graves erros de julgamento científico que foram descobertos e divulgados. Um belo exemplo foi sua decisão de classificar o homem em uma subclasse separada do Mammalia (ver Thomas Henry Huxley). Neste Owen não tinha nenhum apoio. Além disso, sua relutância em sair da cerca em relação à evolução tornou-se cada vez mais prejudicial para sua reputação com o passar do tempo.
Owen continuou trabalhando depois de sua aposentadoria oficial aos 79 anos de idade, mas nunca recuperou as boas opiniões que tinha recebido em seus dias de juventude.