Squamata

Os squamates são um grupo monofilético que é um grupo irmão do tuatara. Os squamates e tuatara juntos são um grupo irmão de crocodilos e pássaros, os arcossauros vivos.

Os fósseis de squamate aparecem pela primeira vez no início do Jurássico, mas uma filogenia mitocondrial sugere que eles evoluíram no final do Permiano. As relações evolutivas dentro dos squamates ainda não estão completamente trabalhadas, sendo a relação das cobras com outros grupos a mais problemática.

A partir de dados morfológicos, acredita-se que os lagartos Iguanid divergiram de outros squamates muito cedo, mas filogenias moleculares recentes, tanto do DNA mitocondrial quanto do nuclear, não suportam esta divergência precoce. Como as serpentes têm um relógio molecular mais rápido do que outros esquilos, e há poucos fósseis precoces de cobras e ancestrais de cobras, é difícil resolver a relação entre as serpentes e outros grupos de esquilos.

Pesquisas recentes sugerem que a origem evolutiva do veneno está profundamente na filogenia do squamate. 60% dos squamates são venenosos Toxicofera.

O veneno nas famílias Caenophidia, Anguimorpha, e Iguania evoluiu uma vez, depois as três famílias divergiram. Todas as três linhagens compartilham nove toxinas comuns. O registro fóssil mostra que a divergência entre anguimorfos, iguanos e cobras avançadas data de aproximadamente 200 MYA para o Jurássico Superior Triássico/Baixo.

O veneno da cobra evoluiu pela duplicação de um gene codificador de uma proteína reguladora ou bioativa normal. Em seguida, a cópia foi expressa na glândula venenosa.

Diferentes toxinas foram recrutadas a partir de diferentes proteínas e são diversas como as próprias funções.

A seleção natural tem impulsionado a diversificação das toxinas para contrariar as defesas da presa. Os genes do veneno formam grandes famílias multigenas, e evoluem pela evolução das proteínas. Isto leva a uma diversificação das toxinas que permitem que os predadores de sit-and-wait ataquem uma ampla gama de presas.

A rápida evolução e diversificação é o resultado de uma corrida armamentista evolutiva de presas/predadores, onde cada um se adapta para se contrapor ao outro.

Classicamente, o pedido é dividido em três subordens:

• Lacertilia, os lagartos;
• Serpentes, as serpentes;
• Amphisbaenia, os lagartos vermelhos.

Destes, os lagartos formam um grupo paraplégico. Nas classificações mais recentes, o nome Sauria é usado para répteis e aves em geral, e os Squamata são divididos de forma diferente:

• Subordem Iguania (as iguanas e os camaleões)
• Subordem Scleroglossa
• Infraorder Gekkota (os geckos)
• Infraorder Anguimorpha (os monitores, o monstro Gila, e as tempestades lentas)
• Infraorder Scincomorpha (lagartos de pele, lagartos de cauda de chicote e lagartos europeus comuns)
• Serpentes de subordem (as serpentes)
• Infraorder Alethinophidia (víboras, jóias, cobras, etc.)
• Infra-ordem Scolecophidia (cobras cegas)
• Subordem Amphisbaenia