Botânica
Darwin formou a Sociedade Botânica Lichfield para traduzir as obras da botânica sueca Carolus Linnaeus do latim para o inglês. Isto levou sete anos. O resultado foram duas publicações: Um Sistema de Vegetais entre 1783 e 1785, e The Families of Plants, em 1787. Nesses volumes, Darwin cunhou muitos dos nomes de plantas ingleses que usamos hoje.
Darwin escreveu então The Loves of the Plants, um longo poema, que foi uma interpretação popular das obras de Linnaeus. Darwin também escreveu Economia da Vegetação, e juntos os dois foram publicados como O Jardim Botânico.
Seu último longo poema, o Templo da Natureza, foi publicado após sua morte, em 1803. Esta é considerada sua melhor obra poética. Centra-se em sua própria teoria da evolução recém-concebida, traçando a progressão da vida desde os microorganismos até a sociedade civilizada.
Zoologia
O trabalho científico mais importante de Darwin é Zoönomia (1794-1796), que contém um sistema de patologia e um tratado sobre geração, no qual ele antecipou algumas das idéias de Lamarck sobre evolução.
A essência de sua visão está contida na seguinte passagem, que ele segue com a conclusão de que um e o mesmo tipo de filamento vivo é e tem sido a causa de toda a vida orgânica:
Seria ousado demais imaginar que, no grande período de tempo desde que a Terra começou a existir, talvez milhões de anos antes do início da história da humanidade, seria ousado demais imaginar que todos os animais de sangue quente surgiram de um único filamento vivo, que a grande Primeira Causa suportou (investiu) com a animalidade, com o poder de adquirir novas peças, atendidas com novas propensões, dirigidas por irritações, sensações, volições e associações, e assim possuindo a faculdade de continuar a melhorar por sua própria atividade inerente, e de entregar essas melhorias por geração a sua posteridade, mundo sem fim!
Esta é uma afirmação clara do tipo de pensamento evolutivo pelo qual Lamarck é conhecido.
Trabalhos posteriores
A idéia de evolução de Darwin surgiu em várias de suas outras obras. No livro Loves of the Plants (1789), reimpresso em várias edições como The Botanic Garden, ocorre o comentário: "Talvez todas as produções da natureza estejam em seu progresso para uma maior perfeição". Todas estas obras de história natural estão na forma de poemas, e por isso não são satisfatórias do ponto de vista da ciência moderna. Mas o século XVIII foi uma época em que homens inteligentes fizeram conexões; os tipos especializados de cientistas ocorreram primeiro na vida de seu neto Charles.
As duas últimas folhas do plano A de Darwin para a condução da educação feminina em colégios internos (1797) contêm uma lista de livros, um pedido de desculpas pelo trabalho e um anúncio para a "Miss Parkers School". O trabalho provavelmente resultou de sua ligação com Mary Parker. A escola anunciada na última página é a que ele montou em Ashbourne, Derbyshire, para seus dois filhos ilegítimos, Susanna e Mary.