O pai de Locke, que também se chamava John Locke, era um advogado do país. Ele havia servido como capitão na parte inicial da
Guerra Civil inglesa. Sua mãe, Agnes Keene, era filha de um
curtidor e era considerada muito bonita. Tanto a mãe quanto o pai eram
puritanos. Locke nasceu em 29 de agosto de 1632, em uma cabana da igreja em Wrington, Somerset, a cerca de 12 milhas de
Bristol. Ele foi
batizado quando nasceu. Depois disso, sua família logo se mudou para Pensford.
Em 1647, Locke foi enviado para a Westminster School em Londres. Durante este período, ele estava sendo patrocinado por Alexander Popham, um membro do Parlamento. Depois de terminar seus estudos lá, ele foi para a Igreja de Cristo. Embora Locke fosse um bom aluno, ele não gostava do horário do tempo que lá passava. Ele não gostava das matérias clássicas ensinadas na universidade, e queria aprender mais sobre filosofia moderna. Através de seu amigo Richard Lower, que havia conhecido na escola, Locke aprendeu sobre medicina.
Locke recebeu um bacharelado em 1656 e um mestrado em 1658. Em 1666, ele conheceu Lord Anthony Ashley Cooper, que tinha vindo a Oxford em busca de tratamento para sua doença hepática. Cooper ficou impressionado com Locke e pediu-lhe que viesse.
Locke estava procurando um emprego e em 1667 mudou-se para a casa de Shaftesbury na Exeter House em Londres, para servir como médico pessoal de Lord Ashley. Em Londres, Locke continuou seus estudos de medicina.
O conhecimento médico da Locke foi posto à prova quando a doença hepática de Shaftesbury piorou até que Shaftesbury estava prestes a morrer. Locke usou o conselho de vários médicos e persuadiu a Shaftesbury a ir a uma operação. A Shaftesbury viveu a operação e agradeceu a Locke por salvar sua vida.
A Shaftesbury, como membro do movimento Whig, foi uma grande influência nas idéias políticas da Locke. Entretanto, depois que Shaftesbury começou a cair de favor em 1675, Locke decidiu viajar através da França. Ele retornou à Inglaterra em 1679. Nesta época, devido à insistência de Shaftesbury, Locke escreveu os Dois Tratados de Governo. Enquanto se pensava uma vez que Locke escreveu os Tratados para defender a Gloriosa Revolução de 1688, a recente bolsa de estudos mostrou que o trabalho foi composto antes mesmo de este começar.
Entretanto, Locke fugiu para a Holanda em 1683. Isto porque as pessoas suspeitaram que ele estivesse envolvido no Lote de Centeio para assassinar o Rei Carlos II da Inglaterra. Na Holanda, Locke teve tempo de voltar à sua escrita, passando muito tempo reelaborando o Ensaio. Locke não voltou para casa até depois da Revolução Gloriosa. Locke voltou com a esposa de Guilherme de Orange para a Inglaterra em 1688.
A amiga íntima de Locke, Lady Masham, convidou-o a se juntar a ela na casa de campo de Mashams, em Essex. Embora seu tempo lá fosse marcado por uma saúde variável devido a ataques de asma, ele se tornou, no entanto, um herói intelectual dos Whigs. Durante este período ele discutiu assuntos com figuras como John Dryden e Isaac Newton.
Ele morreu em 28 de outubro de 1704, e está enterrado no adro da aldeia de High Laver, a leste de Harlow, em Essex, onde vivia na casa de Sir Francis Masham desde 1691. Locke nunca se casou nem teve filhos.
Os eventos que aconteceram durante a vida de Locke incluem a Restauração Inglesa, a Grande Peste de Londres e o Grande Incêndiode Londres. Ele não viu bem os Atos da União 1707, embora os tronos da Inglaterra e da Escócia tenham sido mantidos em união pessoal durante toda a sua vida. A monarquia constitucional e a democracia parlamentar estavam em seus primórdios durante o tempo de Locke.
