A biologia evolutiva do desenvolvimento interpreta o desenvolvimento à luz da evolução e da genética moderna. É chamado de "evo-devo" curto.

Em Sobre a Origem das Espécies (1859), Charles Darwin propôs a evolução através da seleção natural, uma teoria central para a biologia moderna. Darwin reconheceu a importância do desenvolvimento embrionário na compreensão da evolução:

"Podemos ver porque os caracteres derivados do embrião devem ter a mesma importância que os derivados do adulto, pois uma classificação natural inclui, é claro, todas as idades".

Ernst Haeckel (1866) propôs que "a ontogenia recapitula a filogenia", ou seja, o desenvolvimento do embrião de cada espécie (ontogenia) repete o desenvolvimento evolutivo dessa espécie (filogenia). O conceito de Haeckel explicou, por exemplo, por que os seres humanos, e de fato todos os vertebrados, têm fendas branquiais e caudas no início do desenvolvimento embrionário. Desde então, sua teoria tem sido amplamente desacreditada.