Pré-histórico
Pesquisas arqueológicas têm revelado sinais de vida humana em Sulawesi do Norte desde 30.000 anos atrás, com base em evidências na caverna Liang Sarru, na ilha de Salibabu. Outras evidências mostram vida há cerca de 6.000 anos no local de Passo Hillside no distrito de Kakas e há 4.000 anos até o início da década de d.C. na caverna Liang Tuo Mane'e em Arangkaa, na ilha de Karakelang.
Período inicial
Período Colonial
No final do século 16, portugueses e espanhóis chegaram ao Norte de Sulawesi. O Portugal foi a primeira nação ocidental a chegar ao Norte de Sulawesi. Um navio português desembarcou em Manado. O Sultanato de Maguindanao controlava as ilhas do norte naquela época. Os portugueses construíram o forte em Amurang.
O navio espanhol atracou na ilha de Talaud e Siau, em direção a Ternate. A Espanha construiu o Forte em Manado, desde então Minahasa começou a controlar a Espanha. A resistência contra a ocupação espanhola culminou em 1660-1664.
O navio holandês desembarcou na cidade de Manado em 1660 para ajudar na luta da Confederação Minahasa contra a Espanha. A associação republicana das Nações Unidas de membros da Confederação Minahasa celebrou um acordo comercial com o COV. Este acordo de cooperação comercial fez com que o COV monopolizasse o comércio, que gradualmente começou a impor sua vontade, acabando levando à resistência do século XVII em Ratahan que culminou na Guerra Minahasa holandesa em 1809-1811 em Tondano.
Os espanhóis já haviam colonizado as Ilhas Filipinas. Eles fizeram de Minahasa uma plantação de café. A Espanha fez de Manado um centro de comércio de café para os comerciantes chineses. Algumas tribos Minahasan ajudaram a Espanha a capturar o forte português em Amurang na década de 1550. Os colonos espanhóis então construíram o forte em Manado. Finalmente, a Espanha controlava toda a Minahasa.
No século XVI, uma das primeiras comunidades indo-euroasiáticas do arquipélago foi em Manado. O primeiro rei de Manado foi Muntu Untu (1630). Ele era metade da ascendência espanhola. Mais tarde, a Espanha deu Minahasa aos portugueses em troca de 350.000 ducados em um tratado. Os governantes de Minahasa enviaram Supit, Pa'at, e Lontoh para lutar com os holandeses para forçar os portugueses a saírem de Minahasa. Eles conseguiram em 1655. Eles construíram sua própria fortaleza em 1658 e expulsaram os últimos portugueses alguns anos mais tarde.
No início do século XVII, os holandeses haviam derrubado o sultanato de Ternate. Eles começaram a reduzir o poder da Espanha e de Portugal no arquipélago. Em 1677, os holandeses conquistaram o arquipélago de Sangir. Dois anos mais tarde, Robert Padtbrugge, o governador de Maluku, visitou Manado. Ele fez um acordo com os chefes do Minahasan. Isto permitiu que os holandeses dominassem durante os próximos 300 anos. Entretanto, o domínio direto pelos holandeses só começou em 1870. Os holandeses ajudaram a unir a confederação de Minahasa. Em 1693 os Minahnianos obtiveram uma vitória militar contra a tribo Mongondow no sul do país. A influência holandesa aumentou e o cristianismo e a cultura européia cresceram em Minahasa. As escolas missionárias em Manado, em 1881, foram uma das primeiras tentativas de educação em massa na Indonésia. Os graduados das escolas puderam encontrar trabalho como funcionários públicos, no exército e no governo das Índias Orientais Holandesas. As relações de Minahasa com os holandeses eram muitas vezes pobres. Houve uma guerra entre os holandeses e Tondano em 1807 e 1809. O território Minahasa não estava sob domínio direto dos holandeses até 1870. Mas eventualmente os holandeses e Minahasa se tornaram muito próximos. Assim, Minahasa era freqüentemente chamada a 12ª província holandesa. Mesmo em 1947, Manado formou o movimento político de Twapro, abreviação de Twaalfde Profincie (Décima Segunda Província) que queria a integração formal de Minahasa no Reino dos Países Baixos.
Independência
Os japoneses ocuparam a área de 1942 a 1945. foi um período de privação, e as forças aliadas bombardearam muito Manado em 1945. Durante o período de independência depois disso, houve uma divisão entre Minahasa pró-Indonésio e pró-Holandês. A nomeação de Sam Ratulangi como o primeiro governador do leste da Indonésia conseguiu então ganhar o apoio de Minahasa para a República da Indonésia. Após a independência indonésia, a Indonésia é dividida em 8 províncias, e Sulawesi é uma dessas províncias. O primeiro governador de Sulawesi foi S.G.J.Ratulangi, também conhecido como um herói nacional. Em 1948, em Sulawesi foi formado o Estado da Indonésia Oriental, que mais tarde se tornou um dos estados dentro dos Estados Unidos da Indonésia. O Estado do Leste da Indonésia foi dissolvido e fundido com a República da Indonésia. Com base na Lei número 13 Ano 1964, formou-se a Província de Sulawesi Norte. O 14 de agosto de 1959 foi designado como o aniversário da província.
Em março de 1957, os líderes militares de Sulawesi do Norte e do Sul exigiram mais liberdade de Java. Eles queriam um desenvolvimento mais ativo, compartilhando o dinheiro dos impostos de forma justa, e ajuda contra a rebelião de Kahar Muzakar em Sulawesi do Sul. Eles queriam um governo central liderado tanto por Sukarno quanto por Hatta igualmente. No início o movimento da "Permesta" (Carta da Luta do Universo) era apenas um movimento de reforma e não um movimento separatista.
As negociações entre o governo central e os líderes militares de Sulawesi evitaram a violência em Sulawesi do Sul, mas os líderes de Minahasan não ficaram satisfeitos com o resultado do acordo e o movimento irrompeu. Com medo do domínio do sul, os líderes de Minahasan declararam seu próprio estado autônomo do norte de Sulawesi em junho de 1957. Naquela época o governo central tinha controlado o Sulawesi Sul, mas no Norte não havia figuras fortes do governo central e havia rumores de que os Estados Unidos estava armado com a rebelião em Sumatra Norte, também tem ligações com os líderes de Minahasan.
A possibilidade de intervenção estrangeira levou o governo central a solicitar a assistência militar do sul de Sulawesi. As forças Permesta foram mais tarde retiradas do Sulawesi Central, Gorontalo, Sangir, e Morotai em Maluku. Os aviões Permesta (fornecidos pelos EUA e pilotados por pilotos filipinos, taiwaneses e americanos) foram destruídos. Os EUA então seguiram em frente e, em junho de 1958, o exército do governo central aterrissou em Minahasa. A revolta de Permesta terminou em meados de 1961.
As rebeliões de Sumatra e Sulawesi fracassaram. Elas até ajudaram a criar o que não queriam, pois o centro reagiu à ameaça de rebelião. A autoridade do governo central aumentou enquanto a autonomia regional ficou mais fraca. O nacionalismo radical se tornou mais forte. O poder do partido comunista e o poder de Sukarno aumentou enquanto Hatta enfraquecia. Sukarno finalmente estabeleceu a democracia guiada em 1958.
Desde as reformas de 1998, o governo indonésio começou a adotar leis que reforçam a autonomia regional, a principal idéia pela qual a Permesta luta.
