A clorofila é necessária para a fotossíntese, o que permite às plantas obter energia da luz.
As moléculas de clorofila estão dispostas dentro e ao redor das membranas dos cloroplastos. Ela serve a duas funções principais. A função da maioria das clorofilas (até várias centenas de moléculas por sistema fotográfico) é absorver a luz e transferir essa energia luminosa para os centros de reação. Estes pigmentos recebem o nome do comprimento de onda (em nanômetros) de sua absorção máxima de pico vermelho. Estes pigmentos de clorofila podem ser separados em uma simples experiência de cromatografia em papel.
A função do centro de reação clorofila é utilizar a energia transferida para ele dos outros pigmentos clorofílicos para sofrer uma reação redox específica. Nesta reação, a clorofila dá um elétron a uma cadeia de transporte de elétrons. Esta reação é como organismos fotossintéticos como as plantas produzem gás O2, e é a fonte para praticamente todo o O2 na atmosfera terrestre. O Photosystem I normalmente funciona em série com o Photosystem II.
O fluxo de elétrons produzido pelos pigmentos clorofila do centro de reação é usado para transportar íons H+ através da membrana, estabelecendo um potencial quimiossimótico usado principalmente para produzir energia química ATP; e esses elétrons finalmente reduzem NADP+ para NADPH, um redutor universal usado para reduzir CO2 em açúcares, bem como para outras reduções biossintéticas.
Uma lesma verde do mar, Elysia chlorotica, foi encontrada para usar a clorofila que comeu para realizar a fotossíntese por si mesma. Este processo é conhecido como cleptoplastia, e nenhum outro animal foi encontrado que tenha esta capacidade.
Por que verde e não preto?
Ainda não está claro exatamente por que as plantas evoluíram, em sua maioria, para serem verdes. As plantas verdes refletem principalmente a luz verde e quase verde, em vez de absorvê-la. Outras partes do sistema de fotossíntese ainda permitem que as plantas verdes utilizem o espectro da luz verde (por exemplo, através de uma estrutura foliar que prende a luz, carotenóides, etc.). As plantas verdes não utilizam uma grande parte do espectro visível da forma mais eficiente possível. Uma planta preta pode absorver mais radiação, e isto pode ser muito útil, não suportando os problemas de descarte deste calor extra (por exemplo, algumas plantas devem fechar suas aberturas, chamadas estoma, em dias quentes para evitar perder muita água). Mais precisamente, a questão se torna por que a única molécula absorvente de luz utilizada para a energia nas plantas é verde e não simplesmente preta.
O biólogo John Berman disse que a evolução não é um processo de engenharia, portanto muitas vezes tem limites que um engenheiro ou outro projetista não tem. Mesmo que as folhas pretas fossem melhores, as limitações da evolução podem impedir que as espécies se tornem tão eficientes quanto possível. Berman escreveu que conseguir pigmentos que funcionem melhor que a clorofila pode ser muito difícil. De fato, acredita-se que todas as plantas superiores (embriófitas) evoluíram de um ancestral comum que é uma espécie de algas verdes - portanto, a clorofila evoluiu apenas uma vez (ancestral comum).
Shil DasSarma, um geneticista microbiano da Universidade de Maryland, apontou que espécies de arquebactérias utilizam outra molécula absorvente de luz, a retina, para obter energia do espectro verde. Alguns cientistas acreditam que os arquebactérias absorventes de luz verde foram outrora os mais comuns no ambiente terrestre. Isto poderia ter deixado aberto um "nicho" para os organismos verdes que absorveriam os outros comprimentos de onda da luz solar. Esta é apenas uma possibilidade, e Berman escreveu que os cientistas ainda não estão convencidos de uma única explicação.