Glenrowan
A quadrilha decidiu que Aaron Sherritt, o melhor amigo de Joe Byrne, era um espião da polícia. Na noite de 26 de junho de 1880, Dan Kelly e Joe Byrne foram à casa de Sherritt no Vale Woolshed, perto de Beechworth, e o mataram. Os quatro policiais que o protegiam na época se esconderam debaixo da cama e não denunciaram o assassinato até o dia seguinte. Os bandidos sabiam que a polícia enviaria homens extras para Beechworth de trem para tentar capturá-los. Ned Kelly e Hart chegaram a Glenrowan em 27 de junho, e fizeram 70 reféns no Glenrowan Inn (hotel). Eles sabiam que um trem carregado com a polícia estava a caminho. Eles forçaram os trabalhadores ferroviários em Glenrowan a puxar os trilhos do trem para fazer o trem cair. Os bushrangers, usando armaduras caseiras, capturariam então qualquer um dos policiais que estivessem vivos após o acidente. Com a polícia fora do caminho, a gangue Kelly entraria então em Benalla e roubaria o banco. A polícia capturada seria libertada quando Ellen Kelly, William Williamson e William Skillion, fossem soltos da prisão.
Mas o plano de descarrilar o trem da polícia falhou. A polícia que protegia Aaron Sherritt estava muito assustada para deixar sua barraca e o assassinato só foi relatado no dia seguinte. Os Kellys tiveram que esperar 24 horas mais pelo trem da polícia do que haviam planejado. Os reféns estavam se tornando difíceis de controlar. Para mantê-los entretidos, os foras-da-lei fizeram uma dança no hotel, onde Kelly dançou uma quadrilha com Jane Jones, filha do proprietário do hotel. Eles também tiveram eventos esportivos, incluindo o salto, o passo e o salto. Kelly usou dois revólveres como pesos extras enquanto participava dos saltos. Um professor da escola local, Thomas Curnow, convenceu Ned a deixá-lo levar sua família para casa. Assim que ele estava livre, Curnow desceu até a linha ferroviária, acenando com uma lanterna (leve) envolta em seu lenço vermelho. O trem parou em segurança.
Os 46 policiais rapidamente deixaram o trem e se colocaram ao redor do hotel para que a gangue Kelly ficasse presa lá dentro. Os membros da gangue colocaram suas armaduras, feitas de peças de arado. Todos os quatro tinham capacete. A armadura de cada homem era bastante pesada; a de Ned pesava 41,4 kg, o que representava cerca da metade do peso de seu corpo. A polícia atirou suas armas no prédio durante sete horas. Estima-se que 15.000 balas foram disparadas durante o tiroteio. A polícia ordenou um canhão de Melbourne para que eles pudessem destruir a pousada, mas demoraria muito para chegar e, em vez disso, incendiaram o edifício.
Ao amanhecer da segunda-feira, 28 de junho, Ned Kelly saiu da pousada vestindo sua armadura. Ele marchou em direção à polícia, disparando sua arma contra eles. As balas deles ricochetearam em sua armadura. O Sargento Steel atirou em suas pernas que não estavam protegidas por uma armadura. Joe Byrne morreu na sala da frente devido à perda de sangue, porque um tiro cortou sua artéria femoral. Dan Kelly e Steve Hart podem ter se matado, pois seus corpos foram encontrados deitados lado a lado em uma sala dos fundos com a cabeça sobre cobertores. Eles haviam tirado a armadura e ela foi encontrada ao lado deles. Vários reféns foram baleados e três morreram, incluindo Jack Jones, de 13 anos, o filho do proprietário do hotel. Martin Cherry, um trabalhador ferroviário, foi resgatado do hotel queimado, mas morreu logo em seguida. George Metcalfe, um trabalhador da pedreira, que foi forçado a puxar a linha férrea, morreu mais tarde devido a ferimentos. A polícia teve um pequeno ferimento; o superintendente da polícia, Francis Hare, recebeu um ferimento no pulso e depois fugiu da batalha. A Comissão Real, criada para examinar a gangue Kelly, retirou mais tarde Hare da Polícia de Victoria.
Julgamento e execução
Ned Kelly foi levado para o Gaol de Melbourne, onde foi tratado de suas feridas. Ele foi visitado por sua mãe, que estava na mesma prisão por ter ferido o policial Fitzpatrick. Em agosto ele foi levado de volta a Beechworth de trem para as primeiras audiências do tribunal. O tribunal concordou que Kelly seria julgado no tribunal pelo assassinato de Thomas Lonigan e Michael Scanlon em Stringybark Creek. O governo pensou que as pessoas ao redor de Beechworth poderiam não considerar Kelly culpado dos crimes, e assim eles fizeram com que o julgamento fosse transferido para Melbourne. No julgamento, o júri considerou Kelly culpada de ambos os assassinatos. Ele foi condenado à morte pelo juiz irlandês Sir Redmond Barry com as palavras "Que Deus tenha piedade de sua alma". Kelly disse: "Irei um pouco mais longe que isso e direi que o verei lá quando eu for".
Muitas pessoas não concordavam com a sentença de morte. Uma petição com mais de 60.000 nomes pediu misericórdia ao governo. Ned Kelly foi enforcado em 11 de novembro de 1880, no Gaol de Melbourne, por assassinato. Vários jornais, incluindo The Age e The Herald, relataram as últimas palavras de Kelly como "Tal é a vida". Sir Redmond Barry morreu após uma curta doença em 23 de novembro de 1880, apenas 12 dias após a morte de Kelly.
Re-enterramento e testes de DNA recentes
Ned Kelly foi enterrado em uma cova não marcada no Gaol de Melbourne, em uma área com outros criminosos que também haviam sido enforcados no Gaol. Os ossos de 32 pessoas foram desenterrados em 1929 quando a cadeia estava sendo reconstruída, e enterrados novamente em Pentridge Gaol, em Coburg, Victoria. O local do enterro em Pentridge foi redescoberto em 2008. Os testes de DNA provaram que um conjunto de ossos era o esqueleto de Ned Kelly. Especialistas do Instituto Vitoriano de Medicina Legal disseram que o DNA corresponde claramente a um dos parentes vivos de Kelly. Os ossos mostram alguns dos ferimentos que Kelly sofreu durante o tiroteio com a polícia. O esqueleto de Kelly não tem um crânio.
Um crânio, dito ser de Kelly, foi encontrado durante a escavação na cadeia, em 1929. Foi colocado em exposição na antiga Gaol de Melbourne, mas foi roubado em 1978. No aniversário do enforcamento de Ned Kelly, 11 de novembro de 2009, um fazendeiro da Austrália Ocidental devolveu um crânio à Heritage Victoria, que ele disse ter sido retirado da cadeia. Ele foi testado para DNA para ver se era o crânio de Ned Kelly. Estes testes mostraram que não era, e a localização do crânio de Kelly ainda é desconhecida.
Em 2013, o governo vitoriano finalmente entregou os restos mortais de Kelly à sua família. Um funeral foi realizado na Igreja de St. Patrick, Wangaratta, em 18 de janeiro de 2013. Durante o culto, os membros da família que leram a Bíblia usaram uma faixa de seda verde. Parentes do Constable Michael Scanlon e Aaron Sherrit também participaram do culto. Kelly foi enterrada em uma cova não marcada em Greta no dia 20 de janeiro de 2013.
O DNA que foi recuperado do esqueleto de Ned era o DNA mitocondrial. Isso foi combinado com uma das relações maternas de Ned (o sobrinho-neto de Ned Leigh Olver). Nenhum Y-DNA de qualidade adequada foi recuperado dos ossos do Ned ou foi recuperado de qualquer parente conhecido do lado paterno do Ned (o Y-DNA é passado de pai para filho). Há uma chance de que uma amostra do Y-DNA possa um dia ser isolada dos ossos de Ned usando procedimentos laboratoriais mais avançados, entretanto, também é possível que uma amostra do Y-DNA possa ser retirada dos restos mortais de um dos parentes masculinos de Ned, como seu pai, seus tios ou seus irmãos. Seus túmulos são todos bem conhecidos. Uma amostra de Y-DNA revelaria exatamente a qual linha Kelly Ned pertence. Atualmente o estudo Kelly Surname Y-DNA tem os resultados de mais de 500 amostras Y-DNA, mas nenhuma comparação pode ser feita até que uma amostra de uma das famílias de Ned seja obtida. Com base na localização, a linha Kelly mais freqüente no sudoeste da Irlanda (Tipperary, Clare e Kerry) é a linha O'Brien-Kelly (L226+).