A alternância de gerações é um conceito importante na evolução das plantas. Todas as plantas terrestres têm alternância de gerações.
Em musgos e seus parentes (Bryophytes), o gametófito haplóide é a geração dominante, e os esporófitos diplóides são hastes esporângios que crescem a partir dos gametófitos. Em samambaias, o esporófito diplóide é muito maior, mas o gametófito haplóide é também uma pequena planta que pode crescer por um longo tempo.
Para plantas floríferas (Angiospermas), a geração de esporófitos é quase todo o ciclo de vida (a planta verde, raízes, etc.) exceto as pequenas estruturas reprodutivas (pólen e óvulo).
O esporófito produz esporos (daí o nome), por meiose. Estes se transformam em um gametófito. Tanto os esporos quanto o gametofito resultante são haplóides, o que significa que eles têm metade dos cromossomos. Mais tarde, o gametófito maduro produz gametas masculinos ou femininos (ou ambos) por mitose. A fusão de gametas masculinos e femininos (fertilização) produz um zigoto diplóide que se desenvolve em um novo esporófito. Este é o ciclo que é conhecido como alternância de gerações ou alternância de fases.
Como um fator na evolução da planta
No trabalho de referência Variação e evolução nas plantas, Stebbins discutiu como a alternância de gerações se relacionava com a evolução geral das plantas. Ele começou:
"A diferença mais marcante entre o ciclo sexual dos animais e aqueles encontrados nas plantas é que, com exceção de alguns Protozoários, os animais são diplóides em todos os estágios, enquanto quase todas as plantas possuem um estágio haplóide de maior ou menor duração. Além disso, a seqüência de tipos de alternância de gerações... é uma das características mais conhecidas da evolução das plantas... A geração diplóide sem dúvida evoluiu independentemente muitas vezes diferentes".
Comentários posteriores de Stebbins:
"A condição diplóide traz um aumento de flexibilidade porque torna possível a condição de dominância genética e recessividade. Em um organismo haplóide, toda nova mutação é imediatamente exposta à ação de seleção. Em um organismo diplóide, por outro lado, cada novo mutante surge como um heterozigoto e, se recessivo, é abrigado da seleção".
A questão é que, em diploides, novos alelos são abrigados e (coletivamente) são um reservatório de variação potencial na população.
Algas
A maioria das algas tem gerações de gametófitos dominantes, mas em algumas espécies os gametófitos e esporófitos são morfologicamente semelhantes (isomórficos).
Bryophytes
Os briófitos (musgos, hepáticas e cornos) têm um estágio de gametófito dominante no qual o esporófito adulto depende do gametófito para a nutrição. O esporófito se desenvolve a partir do zigoto dentro do órgão sexual feminino, portanto, seu desenvolvimento precoce é alimentado pelo gametófito.
Plantas vasculares
Um esporófito independente é a forma dominante em todos os clubmosses, rabos de cavalo, samambaias, gimnospermas e angiospermas (plantas floridas) que sobreviveram até os dias de hoje.
Evolução anterior
As primeiras plantas terrestres tinham esporófitos que produziam esporos idênticos: tinham a mesma aparência, independentemente do sexo em que se desenvolviam. Os ancestrais das gimnospermas desenvolveram complexos ciclos de vida heterosseportivos: os esporos que produziam gametófitos masculinos e femininos eram de tamanhos diferentes. Os megasporos femininos tendem a ser maiores, e em menor número, do que os microsporos masculinos.
Durante o Devonian, vários grupos de plantas desenvolveram independentemente o heterosporismo e mais tarde o endosporismo, no qual os megasporos individuais eram mantidos dentro dos esporângios do esporófito pai. Estes megasporos endosporos tinham uma gametófita fêmea miniatura multicelular com órgãos sexuais femininos e óvulos. Os óvulos eram fertilizados por espermatozóides de natação livre produzidos por gametófitos masculinos miniaturizados pelo vento, na forma de pré-pólen.
O zigoto resultante se desenvolveu para a próxima geração de esporófitos enquanto ainda dentro do único grande megasporo feminino no esporângio do esporófito pai. A evolução do heterosporo e do endosporo estavam entre os primeiros passos na evolução das sementes do tipo produzido por gimnospermas e angiospermas.