Manor Farm é dirigida pelo Sr. Jones, um agricultor cruel e embriagado. Um dia, os animais se reúnem para ouvir o Velho Major, um porco velho e sábio. O Velho Major faz um discurso, pedindo aos animais que se levantem contra seus fazendeiros. Os animais estão muito entusiasmados com a idéia. O Velho Major morre alguns dias depois. Os porcos, que são os animais mais inteligentes, começam a planejar uma rebelião. Eles são liderados por Snowball e Napoleon.
Cerca de três meses mais tarde, os animais se revoltam contra o Sr. Jones e assumem o controle da fazenda. Eles mudam seu nome para "Fazenda Animal". Eles decidem que a fazenda agora será governada somente por animais, chamando o sistema de "animalismo". Eles escrevem sete mandamentos, sendo o mais importante: "Todos os animais são iguais". "Quatro patas boas, duas patas más" torna-se um cântico popular para as ovelhas. O Sr. Jones e seus amigos atacam a fazenda para tentar levá-la de volta, mas na "Batalha da vacaria" os animais os afugentam. O Sr. Jones foge e nunca mais retorna.
Bola de Neve e Napoleão caem um com o outro, pois têm idéias diferentes de como a Fazenda Animal deve ser conduzida. Snowball anuncia planos para construir um moinho de vento, mas Napoleão discorda. Napoleão treina nove filhotes de cachorro, que crescem e se transformam em cães viciosos que o servirão. Quando os cachorros estão completamente crescidos, ele os usa para perseguir Bola de Neve para fora da fazenda. Ele toma o controle e governa a fazenda sozinho (como um ditador). Napoleão usa os cães para matar qualquer animal que não concorde com ele, enquanto um porco chamado Squealer continua dizendo aos animais que tudo está bem e que eles devem apoiar Napoleão.
Napoleão muda de idéia e decide construir um moinho de vento, fingindo que a idéia foi sua o tempo todo. O primeiro moinho de vento que eles constroem desmorona. Napoleão culpa este (e outros problemas) sobre Snowball. Ele afirma que Bola de Neve está se esgueirando pela Fazenda Animal arruinando tudo. Muitos animais são mortos por "estarem em contato com Bola de Neve". Napoleão começa a trabalhar com seres humanos do lado de fora, mesmo que isto fosse proibido. Um deles é seu vizinho, um fazendeiro chamado Sr. Frederick. Ele traz um grupo de homens que invadem a fazenda e destroem o segundo moinho de vento. Os animais os combatem na "Batalha do Moinho de Vento", com grande custo.
Quando os animais constroem um terceiro moinho, Boxer, seu cavalo mais forte, perde sua força por causa da velhice e colapsa. Napoleão o envia para ser abatido, mesmo que Boxer fosse seu amigo. Os porcos continuam a trabalhar com humanos e começam a se comportar como eles, tais como viver na fazenda e andar sobre duas patas. Eles ensinam às ovelhas um novo cântico: "Quatro patas boas, duas patas melhores". Os mandamentos são substituídos pelas palavras "Todos os animais são iguais, mas alguns animais são mais iguais do que outros". No final, outros animais observam os porcos falando com um grupo de humanos e decidem que não podem dizer qual é qual.