A Guerra Civil Americana foi travada em três importantes áreas de terra, ou "teatros". O teatro oriental incluía todas as terras a leste das Montanhas Apalaches. O teatro ocidental incluía tudo entre as Montanhas Apalaches e o Rio Mississippi e ao longo do rio. O teatro Trans-Mississippi incluía o território a oeste do rio Mississippi.
Tanto os Estados Unidos quanto a Confederação tinham suas capitais no teatro oriental. Washington D.C. era a capital dos Estados Unidos desde 1800. Quando o Sul se seccionou, chamou pela primeira vez Montgomery, Alabama, mas logo mudou para Richmond, Virgínia como a capital dos Estados Confederados. Richmond e Washington estão distantes apenas cerca de 145 km (90 milhas). Uma das primeiras batalhas da guerra foi travada na Virgínia. Esta Primeira Batalha de Bull Run aconteceu em 21 de julho de 1861. Os Confederados venceram a batalha. O Exército da União do Potomac tentou capturar Richmond na Campanha da Península durante a primavera de 1862. Nesta época, Robert E. Lee assumiu o comando do Exército da Virgínia do Norte e derrotou o Exército da União. Ele então venceu a Segunda Batalha de Bull Run, em agosto de 1862. Lee tentou vencer a guerra ao invadir Maryland. Quando ele perdeu a Batalha de Antietam, ele se retirou para a Virgínia.
Havia muita guerra naval na Guerra Civil americana, mas a marinha da União era muito mais forte. Lincoln colocou os Confederados sob um bloqueio, o que significava que a marinha da União não deixaria nenhum navio entrar ou sair dos portos do sul. Os Confederados usavam navios chamados de corredores do bloqueio para trazer coisas da Europa. As coisas que os Confederados trouxeram incluíam armas. As marinhas de cada lado também lutavam nos rios. Os navios incluíam as grades de ferro, que eram protegidas por ferro em seus lados, e as grades de algodão, que usavam algodão ao longo de seus lados. Durante a Batalha de Hampton Roads, a Virgínia Confederada de Ironclad lutou contra o Monitor de Ironclad da União. Esta foi a primeira vez na história mundial que dois Ironclads lutaram um contra o outro.
No teatro ocidental, grande parte da luta aconteceu ao longo do rio Mississippi. Ulysses S. Grant foi um importante general da União no oeste. Os Confederados tentaram enviar seus soldados para o estado do Kentucky durante o verão de 1861. Durante os primeiros meses de 1862, o exército da União fez os Confederados recuarem do Kentucky e do oeste do Tennessee. Os Confederados tentaram recuperar o oeste do Tennessee atacando o exército de Grant na Batalha de Shiloh. Grant venceu a batalha. Os Confederados então tentaram enviar seus soldados para o leste do Kentucky durante o outono de 1862. Eles deixaram Kentucky depois de perderem a Batalha de Perryville.
O Norte ganhou o controle de quase todo o Rio Mississippi. Isto se deu ao capturar as cidades ao longo do rio durante o outono de 1862 e a primavera de 1863. No entanto, a Confederação ainda mantinha Vicksburg, uma importante cidade e forte. Se eles segurassem a cidade, os Confederados poderiam mover soldados e suprimentos de um lado do rio para o outro. Grant iniciou o Cerco de Vicksburg durante o mês de maio de 1863. O cerco continuou por um longo tempo. Em 4 de julho de 1863, os Confederados de Vicksburg se renderam a Grant. Este foi um dos pontos de viragem na guerra, pois dividiu a Confederação em duas partes.
Também houve batalhas a oeste do vale do rio Mississippi, no teatro Trans-Mississippi. Por exemplo, duas batalhas importantes foram a Batalhade Wilson's Creek e a Batalha de Pea Ridge. Os Confederados tentaram invadir o Novo México durante fevereiro e março de 1862, mas foram derrotados na Batalha do Passo de Glorieta. Depois que a União capturou Vicksburg, esta área foi separada do resto dos Estados Confederados. Outras batalhas aconteceram nesta área após a captura de Vicksburg.
Durante o cerco de Vicksburg, no oeste, outro ponto de viragem veio no leste. Após vencer algumas batalhas, Lee decidiu invadir novamente o Norte. Lee e seu Exército da Virgínia do Norte entraram na Pensilvânia. O Exército Confederado encontrou o Exército da União perto de Gettysburg, Pensilvânia. Os dois exércitos lutaram a Batalha de Gettysburg. Esta batalha durou três dias: de 1 a 3 de julho de 1863. Morreram mais soldados em Gettysburg do que em qualquer outra batalha da Guerra Civil. A União venceu a batalha. Isto impediu a invasão do Exército Confederado no Norte. Lee e suas tropas foram empurrados de volta para o Sul.
Depois disso, o Presidente Lincoln decidiu que Grant era seu melhor general. Ele colocou Grant no controle de todos os exércitos da União. Lincoln também fez de William T. Sherman o general encarregado das tropas da União na Geórgia. Grant liderou muitos ataques ao exército de Lee. Estas batalhas foram constituídas pela Campanha Overland. Enquanto isso, Sherman queimou Atlanta e Savannah. Ele fez isso para tentar enfraquecer o Sul e dificultar o abastecimento do Exército Confederado com alimentos e outras necessidades. Sherman então marchou para o norte através da Carolina do Sul e da Carolinado Norte. O general confederado Joseph E. Johnston atacou Sherman na Batalha de Bentonville. Sherman venceu a batalha.
Lee resistiu o máximo que pôde na Virgínia. Por fim, ele decidiu que tinha muito poucos soldados para continuar lutando contra a União, que tinha mais soldados e suprimentos. Lee se rendeu a Grant em 9 de abril de 1865, perto da Appomattox Court House. Após a rendição de Lee, muitos outros exércitos confederados também se renderam. O último general confederado a se render foi o Brigadeiro-General Stand Watie. Ele se rendeu em 23 de junho de 1865, em Oklahoma.
Depois que a guerra terminou, o Presidente Lincoln perdoou todos os soldados confederados. Isto significava que os soldados confederados não seriam presos ou punidos por lutarem contra a União. Os estados do sul seriam autorizados a voltar aos Estados Unidos novamente. Entretanto, alguns Confederados não queriam voltar aos Estados Unidos. Algumas dessas pessoas se mudaram para o México ou para o Brasil.