Um espectrômetro de massa é tipicamente usado de duas maneiras: Varredura completa ou monitoramento seletivo de íons (SIM). O GC-MS típico pode funcionar de qualquer maneira sozinho, ou ambos ao mesmo tempo.
MS de varredura completa
Ao coletar dados no modo de varredura completa, uma faixa alvo de fragmentos de massa é selecionada e colocada no método do instrumento. Um exemplo de uma faixa ampla típica de fragmentos de massa a serem monitorados seria m/z 50 a m/z 400. A determinação da faixa a ser usada é em grande parte definida pelo que se espera que esteja na amostra enquanto se está ciente do solvente e de outras possíveis interferências. Se um EM procura fragmentos de massa com um m/z muito baixo, ele pode detectar ar ou outros possíveis fatores interferentes. O uso de uma grande faixa de varredura diminui a sensibilidade do instrumento. A máquina realizará menos varreduras por segundo porque cada varredura levará mais tempo para detectar uma gama mais ampla de fragmentos de massa.
A varredura completa é útil para determinar compostos desconhecidos em uma amostra. Ela fornece mais informações do que o SIM quando se trata de confirmar ou resolver compostos em uma amostra. A maioria dos instrumentos é controlada por um computador que opera um programa de computador chamado "método do instrumento". O método de instrumento controla a temperatura no GC, a taxa de varredura MS e a gama de tamanhos de fragmentos sendo detectados. Quando um químico está desenvolvendo um método de instrumento, o químico envia soluções de teste através do GS-MS em modo de varredura completa. Isto verifica o tempo de retenção do GC e a impressão digital do fragmento de massa antes de passar para um método de instrumento SIM. Instrumentos GC-MS especializados, tais como detectores de explosivos, têm um método de instrumento pré-carregado na fábrica.
Monitoramento de íons selecionados
No monitoramento de íons selecionados (SIM), o método do instrumento se concentra em certos fragmentos de íons. Somente esses fragmentos de massa são detectados pelo espectrômetro de massa. As vantagens do SIM são que o limite de detecção é menor, uma vez que o instrumento está observando apenas um pequeno número de fragmentos (por exemplo, três fragmentos) durante cada varredura. Mais varreduras podem ser realizadas a cada segundo. Como apenas alguns poucos fragmentos de massa de interesse estão sendo monitorados, as interferências de matriz são tipicamente menores. Para melhorar as chances de ler um resultado positivo corretamente, as proporções de íons dos vários fragmentos de massa são comparáveis a um padrão de referência conhecido.
Tipos de ionização
Depois que as moléculas percorrem o comprimento da coluna, passam pela linha de transferência e entram no espectrômetro de massa, elas são ionizadas por vários métodos. Tipicamente, apenas um método de ionização é utilizado em um determinado momento. Uma vez que a amostra é fragmentada, ela será então detectada, geralmente por um diodo multiplicador de elétrons. O diodo trata o fragmento de massa ionizada como um sinal elétrico que é então detectado.
Os químicos selecionam uma técnica de ionização separadamente da escolha do Full Scan ou do monitoramento SIM.
Ionização por elétrons
O tipo mais comum de ionização é a ionização por elétrons (EI). As moléculas entram na EM (a fonte é um quadrupolar ou a própria armadilha de íons em uma EM de armadilha de íons) onde são atingidas por elétrons livres emitidos por um filamento. Isto é como o filamento que se encontraria em uma lâmpada incandescente padrão. Os elétrons atingem as moléculas, fazendo com que a molécula se fragmente de uma forma característica que pode ser repetida. Esta técnica de "ionização dura" resulta na criação de mais fragmentos de baixa relação massa/carga (m/z). EI tem poucos, ou nenhum, fragmento com uma massa próxima à massa da molécula original. Os químicos consideram que a ionização dura está disparando elétrons para as moléculas da amostra. Em contraste, "ionização suave" é colocar uma carga sobre a molécula da amostra, atingindo-a com um gás introduzido. O padrão de fragmentação molecular depende da energia eletrônica aplicada ao sistema, tipicamente 70 eV (Volts de elétrons). O uso de 70 eV ajuda a comparar os espectros gerados da amostra de teste com os espectros conhecidos da biblioteca. (Os espectros da biblioteca podem vir de softwares fornecidos pelo fabricante ou desenvolvidos pelo National Institute of Standards (NIST-USA)). O software pesquisa os espectros da biblioteca usando um algoritmo de correspondência, como o Probability Based Matching ou a correspondência de pontos-produtos. Muitas agências de padronização de métodos agora controlam estes algoritmos e métodos para garantir sua objetividade.
ionização química
Na ionização química (CI), um gás reagente, tipicamente metano ou amônia, é colocado no espectrômetro de massa. Existem dois tipos de IC: IC positivo ou IC negativo. De qualquer forma, o gás reagente irá interagir com os elétrons e o analito e causar uma ionização "suave" da molécula de interesse. Uma ionização mais suave fragmenta a molécula a um grau menor do que a ionização dura do EI. Os químicos preferem o CI ao invés do EI. Isto porque o CI produz pelo menos um fragmento de massa com um peso, que é quase o mesmo que o peso molecular do analito de interesse.
Ionização Química Positiva
Na ionização química positiva (PCI), o gás reagente interage com a molécula alvo, na maioria das vezes com uma troca de prótons. Isto produz a espécie de íon em quantidades relativamente altas.
Ionização Química Negativa
Na ionização química negativa (NCI), o gás reagente diminui o impacto dos elétrons livres sobre o analito alvo. Esta diminuição de energia normalmente deixa o fragmento em grande quantidade. (Os fragmentos não se rompem mais).
Interpretação
O objetivo principal da análise de instrumentos é medir uma quantidade de substância. Isto é feito comparando as concentrações relativas entre as massas atômicas no espectro de massa gerada. Dois tipos de análise são possíveis, comparativa e original. A análise comparativa compara essencialmente o espectro dado a uma biblioteca de espectro para ver se suas características estão presentes para alguma amostra conhecida na biblioteca. Isto é melhor realizado por um computador porque há muitas distorções visuais que podem ocorrer devido a variações na escala. Os computadores também podem correlacionar mais dados (como os tempos de retenção identificados pela GC), para relacionar com mais precisão certos dados.
Outro método de análise mede os picos em relação uns aos outros. Neste método, o pico mais alto é fixado em 100%. Os outros picos dão um valor igual à relação entre a altura do pico mais alto e a altura do pico mais alto. Todos os valores acima de 3% são atribuídos. A massa total do composto desconhecido é normalmente indicada pelo pico pai. O valor deste pico pai pode ser usado para caber com uma fórmula química contendo os vários elementos que se acredita estarem no composto. O padrão isotópico no espectro é único para elementos que possuem muitos isótopos. Portanto, ele também pode ser usado para identificar os vários elementos presentes. Isto informa a fórmula química geral da molécula desconhecida. Como a estrutura e as ligações de uma molécula se separam de maneiras características, elas podem ser identificadas a partir da diferença nas massas dos picos. A estrutura da molécula identificada deve ser consistente com as características registradas pelo GC-MS. Tipicamente, esta identificação é feita automaticamente por programas de computador que vêm com o instrumento. Esses programas combinam os espectros com uma biblioteca de compostos conhecidos que possuem a mesma lista de elementos que poderiam estar presentes na amostra.
Uma análise de "espectro completo" considera todos os "picos" dentro de um espectro. Mas, o monitoramento seletivo de íons (SIM) monitora apenas os picos selecionados associados a uma substância específica. Os químicos assumem que em um determinado tempo de retenção, um conjunto de íons é característico de um determinado composto. O SIM é uma análise rápida e eficiente. O SIM funciona melhor quando o analista tem informações prévias sobre uma amostra ou está procurando apenas algumas substâncias específicas. Quando a quantidade de informações coletadas sobre os íons em um determinado pico cromatográfico de gás diminui, a sensibilidade da análise aumenta. Assim, a análise SIM permite que uma quantidade menor de um composto seja detectada e medida. Mas o grau de certeza sobre a identidade desse composto é reduzido.
GC-tandem MS
Quando uma segunda fase de fragmentação de massa é adicionada, por exemplo, usando um segundo quadrupole em um instrumento quadrupolar, ele é chamado de MS tandem (MS/MS). MS/MS são bons em medir baixos níveis de compostos-alvo em uma amostra com uma matriz de compostos de fundo que não são de interesse.
O primeiro quadrupole (Q1) está conectado com uma célula de colisão (Q2) e outro quadrupole (Q3). Ambos os quadrupolares podem ser usados em modo de varredura ou estático, dependendo do tipo de análise MS/MS utilizada. Os tipos de análise incluem varredura de íons do produto, varredura de íons precursores, Monitoramento de Reação Selecionada (SRM) e Varredura de Perda Neutra. Por exemplo: Quando Q1 está em modo estático (olhando apenas uma massa como no SIM), e Q3 está em modo de varredura, obtém-se o chamado espectro de íons de produto (também chamado de "espectro filha"). Deste espectro, pode-se selecionar um íon de produto proeminente que pode ser o íon do produto para o íon precursor escolhido. O par é chamado de "transição" e forma a base para o SRM. O SRM é altamente específico e elimina quase completamente o fundo da matriz.